Genetic Mapping
Genetic Mapping 을 위한 교 을 위한 교 배 배
A 유전자와 B 유전자 사이의 거리 (genetic map 교배방법
Double heterozygote x Double homozygote AaBb aabb
사람 가계도를 이용한 유전자 지도 사람 가계도를 이용한 유전자 지도
작성 작성 의 문제점 의 문제점
1) 1) 유전자유전자 mappingmapping 을 위해서을 위해서 인위적인위적으로 필으로 필 요한 유전자형을 찾아서
요한 유전자형을 찾아서 교배교배할 수 없다할 수 없다 . . 2) 2) 자연적으로 적절한 교배가 되더라도 자손자연적으로 적절한 교배가 되더라도 자손
의 개체수가 적으므로
의 개체수가 적으므로 통계적 처리가통계적 처리가 힘들힘들 며며 , , 구성원의 유전자형을 다 알 수 없으므구성원의 유전자형을 다 알 수 없으므
로 해석이 힘들다 로 해석이 힘들다 . .
세균의 유전자
세균의 유전자 mappingmapping 은 다음은 다음 33 가지가지 방법에 의해 가능함
방법에 의해 가능함 ㆍㆍ conjugation conjugation
ㆍㆍ transduction transduction
ㆍㆍ transformation transformation
Restriction mapping Restriction mapping
제한효소 인식부위의 위치를 게놈상에 표시제한효소 인식부위의 위치를 게놈상에 표시
RFLPRFLP marker marker 를 게놈 를 게놈 mapping mapping 에 이용할 수 에 이용할 수 있다있다 (( 단점 단점 : marker : marker 수가 적다수가 적다 ))
제한효소 절편의 크기에 제한이 있다제한효소 절편의 크기에 제한이 있다 (( 작은 게작은 게 놈놈 (50 Kb (50 Kb 이하이하 )) 에 적용이 용이에 적용이 용이 ))
50 Kb 50 Kb 이상의 게놈 이상의 게놈 : seven or eight-nucleotide: seven or eight-nucleotide 를 인식하는 제한효소 사용
를 인식하는 제한효소 사용
거대 제한효소절편의 분석 거대 제한효소절편의 분석
OFAGEOFAGE
CHEFCHEF
Optical Mapping- Optical Mapping- 현미경사용현미경사용 -gel stretching-gel stretching
-molecular combing-molecular combing
FISH FISH
형광표지를 사용한 형광표지를 사용한 probeprobe 를 이용를 이용
In situ Hybridization on chromosomeIn situ Hybridization on chromosome
Metaphase chromosomeMetaphase chromosome 고 분해능
고 분해능 FISHFISH
-Mechanically stretched chromosome(
-Mechanically stretched chromosome( 원심분원심분 리리 ))
-Non-metaphase chromosome(interphase) -Non-metaphase chromosome(interphase)
STS mapping STS mapping
HHigh resolution-FISH igh resolution-FISH 보다 우수보다 우수 STS : sequence tagged site
STS : sequence tagged site -EST-EST
-SSLP -SSLP
-random genomic sequence -random genomic sequence STS mapping reagent
STS mapping reagent 가 필요가 필요
STS mapping reagent STS mapping reagent
Radiation hybridRadiation hybrid
- 사람 세포를 방사선 처리사람 세포를 방사선 처리
- Hamster Hamster 세포와 융합세포와 융합
Clone libraryClone library
- High capacity vector High capacity vector 사용하여 평균 사용하여 평균 insert insert 가 가 수백 수백 Kb Kb 되도록 되도록 cloning cloning 함함
- 염색체를 분리하여 염색체를 분리하여 librarylibrary 를 만들 수 있음를 만들 수 있음
Physical mapping Physical mapping
물리적 방법을 사용하여 유전자를 물리적 방법을 사용하여 유전자를 mappingmapping
1. Restriction mapping 1. Restriction mapping 2. FISH
2. FISH
3. STS mapping 3. STS mapping
