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Copyright © 2020 The Korean Society of Fisheries and Aquatic Science pISSN:0374-8111, eISSN:2287-8815
서 론
전복
(Haliotis discus hannai)
은우리나라주요해산양식패류종으로서
2000
년대에들어인공종묘생산기술의발달과해상가두리양식방법의이용을통해양식생산고의많은양적성 장이이루어진바있다
(Park and Kim, 2013).
그러나최근들어 여름철고수온환경의심화에따른생존율저하및빈번한질병 유발등국내전복양식의단위노력당생산성은점차저하되고 있는실정이며,
이에전복의양식생산성개선을위해선발육종 을위시하여여러육종연구들이추진되고있고,
그일환으로서 염색체공학을이용한삼배체(triploidy)
전복의개발과경제형질의평가가진행되고있다
(Park et al., 2018; Kim et al., 2019).
전복양식에서문제를야기시키는여러환경요인들중지구 온난화와관련한수온의증가와여름철고수온환경의장기간 유지가최근전복양식의생산성을저하시키는주요환경요인 들로주목받고있으며
,
때문에고수온충격또는고수온노출 에대한전복의생리반응에대한분자메커니즘을이해하기위 한여러연구들이이루어지고있다(Chen et al., 2019; Kyeong et al., 2020).
특히,
고수온노출또는적응시차등발현하는분 자발현마커들의발굴과이들에대한발현특징을해석하기위 한연구들이전복에서최근이루어진바있으며,
그주요대상 유전자그룹으로서열충격단백질유전자들(heat shock protein
이배체 및 삼배체 전복( Haliotis discus hannai) 치패에서 주요 열충격 단백질 유전자들(heat shock protein genes)의 발현 특징
박철지·김은정 1 ·남윤권 1 *
국립수산과학원 육종연구센터, 1부경대학교 해양바이오신소재학과
Expression Pattern of Major Heat Shock Protein Genes in Diploid and Triploid Abalone Haliotis discus hannai Juveniles
Choul Ji Park, Eun Joeng Kim
1
and Yoon Kwon Nam1
*Genetics and Breeding Research Center, National Institute of Fisheries Sciences, Geoje 46083, Korea
1Department of Marine Bio-Materials and Aquaculture, Pukyong National University, Busan 48513, Korea
Basal and heat shock-induced mRNA expression patterns of major heat shock protein (HSP) genes, including those encoding heat shock protein (HSP) 90, HSP70, HSP70-12A, heat shock inducible protein 70 (HSIP70), heat shock binding protein 1 (HSPBP1), HSP60, and HSP40 were examined in the gill and hepatopancreas of 1-year-old diploid and triploid abalone Haliotis discus hannai juveniles. Under non-stimulated conditions at 19ºC, triploid abalones displayed, in general, higher mRNA levels of various HSPs (HSP70, HSIP70, HSPBP1, HSP70-12A, and HSP60 in the gill and HSIP70, HSPBP1, and HSP60 in the hepatopancreas) than did communally cultured diploids. Con- versely, only the hepatopancreatic expression of HSP70-12A was higher in diploids than in triploids. However, the fold changes in gene expression in response to an acute thermal challenge (elevation from 19 to 30ºC) were gener- ally greater in diploids than in triploids, such that the difference in basal expression was diminished, weakened, or even reversed after heat shock treatment. However, unlike other HSP genes, the basal expression of HSP60 (higher in 3N) was more pronounced after heat shock treatment. Collectively, the results of this study suggest that triploid abalones have different capacities for not only basal expression but also the heat-induced expression of HSPs in an HSP member-dependent manner.
Keywords: Abalone, Haliotis discus hannai , Heat shock protein genes, Thermal changes, Triploidy
*Corresponding author: Tel: +82. 51. 629. 5918 Fax: +82. 51. 629. 5910 E-mail address: [email protected]
This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Non-Commercial Licens (http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/) which permits unrestricted non-commercial use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
Received 3 July 2020; Revised 30 July 2020; Accepted 5 August 2020 저자 직위: 박철지(연구관), 김은정(대학생), 남윤권(교수) https://doi.org/10.5657/KFAS.2020.0515
Korean J Fish Aquat Sci 53(4), 515-523, August 2020
박철지
ㆍ
김은정ㆍ
남윤권516
genes)
및관련유전자들에대한연구들이활발히진행되고있다
(Wan et al., 2012; Sun and Hu, 2016; Shin et al., 2017; Park et al., 2018; Kyeong et al., 2020).
Heat shock protein (HSP) gene family
는열충격에의한세포 내단백질의보호를주기능으로하는molecular chaperone
들로서다양한분자량의크기를갖는여러종류의
HSP member
들
(HSP90, HSP70, HSP60, HSP40
및그외저분자HSPs)
을 포함하며,
각HSP member
내에서도생물종에따라서로다 른다양한isoform
들이존재하는것으로알려져있다(Kregel, 2002; Kampinga et al., 2009).
아울러일부HSP member
들의 경우일반적인스트레스반응인자(general stress response fac- tor)
로작동함으로써고수온충격외에산화성스트레스(oxida- tive stress)
및감염(infection)
등에대한세포방어기능의단 백질로서도그역할을수행함이보고되고있다(Brokordt et al., 2015; Dubey et al., 2015).
전복의경우역시최근
whole genome assembly
와고수온발 현transcripts
들의대량발굴실험을통해서다양한HSP mem-
ber
들과isoform
들이생물정보학 분석에 의해 동정된바 있으나
(Nam et al., 2017; Kyeong et al., 2020),
아직전체HSP member
들의isoform
들에대한명명및 분류체계(nomencla- ture)
는부분적으로완성되어있지는못한상태이다.
하지만,
전 복류를포함한여러수산생물종들을대상으로수행된HSP
유 전자발현에관한여러선행연구들은동일한고수온자극에대 해서HSP member/isoform
특이적인차등발현을나타내며,
그 차등발현패턴은자극원에대한유도발현의민감도,
차등발 현의양적인절대량,
차등발현유발주요조직등에서생물종 뿐만아니라계통등에서도그차이가관찰됨이보고된바있다(Cheng et al., 2007; Wang et al., 2011; Shiel et al., 2014).
유도된
3
배체(triploidy)
는일반적인2
배체(diploidy)
에비해 서1.5
배증가된genome
크기를갖도록설계된개체로서2
배 체와달리3
개의상동염색체를(homologous chromosomes)
보유하게되므로제
1
감수분열(meiosis I)
에서상동염색체들간의등분할이어렵기때문에감수분열의지연또는억제에따른소 위불임효과
(sterility effect)
의유도된다(Piferrer et al., 2009;
Dheilly et al., 2014).
때문에3
배체유도기술은불임효과를 통한부가적인경제형질의차등발현을유도하거나인위적으 로형성한육종계통또는유전자변형계통의생식학적 제어(reproductive confinement)
전략으로써그가능성을인정받고 있다.
하지만인위적으로유도된3
배체의경우,
주목적형질인 불임성(sterility)
유도외에도세포대사및생리측면에서다양 한비표적형질(non-intended traits)
들에서도이배체와차이를 나타낼수있는데,
이는배수화된이론적으로유전좌위(locus)
별조합가능한대립유전자(allele)
의수가증가할뿐만아니라,
genome
및세포크기의증가로인한세포분열,
세포수및세포대사의차이에기인한다
(Piferrer et al., 2009; Van de Pol et al., 2020).
이에본연구는배수체전복의고수온노출에대한생리반응 특징을평가하기위한연구의일환으로전복에서발굴된바있 는주요
HSP
유전자들을대상으로일반2
배체대조군및3
배체 전복치패에서기초발현및고수온자극에대한유도발현특징 을조사하고자하였다.
재료 및 방법
실험 전복
실험에사용한전복은제
1
극체방출억제를통해유도된3
배 체치패(1
년산;
각장6.5±1.0 cm)
과동일모패로부터생산된 동일연령의이배체치패(
각장6.2±1.2 cm)
들이다(Park et al., 2018; Kim et al., 2019).
이들전복은국립수산과학원육종연구센터
(Geoje, Korea)
에서동일사육시스템에서사육한개체들로서
,
기초발현수준평가는육종연구센터에서사육중인개체 들을직접샘플링하여분석조직을확보하였다.
반면고수온처 리실험의경우육종연구센터에서부경대학교수산과학대학수 해양종합실험실습센터부속어장으로이송후수온19±1ºC
에 서1
주간순치후수온처리실험에사용하였다.
HSP 유전자
분석을위해선발한
HSP
유전자들은전복genome draft
로부 터선행연구를통해보고된바있는유전자들로써, heat shock protein 90 (HSP90) 1
개isoform, HSP70 member
에서3
개iso- forms [HSP70
및heat shock inducible protein 70 (HSIP70)
및HSP70-12A], heat shock binding protein -1 (HSPBP1),
그 리고HSP60
및HSP40 member
에서각1
개의isoform
씩선발 하여총7
개의HSP genes
들을유전자발현분석에이용하였다(Kyeong et al., 2020).
각유전자의Gene ID
및발현유전자를 증폭하기위한RT-PCR
용primer pair
는Table 1
에나타내었다. 수온 자극 처리 및 실험 전복 샘플링
첫째
, 2
배체대조군과3
배체그룹의HSP
유전자들의기초발 현에있어차등유무의여부를조사하기위해서동일사육시스템내에서개체별전자표식칩을이용
, 19±1ºC
에서혼합사육(communal culture)
중인2
배체와3
배체를무작위로선발하여(
그룹당6
개체)
아가미및간췌장에서발현하고있는각HSP
유 전자들의발현수준을조사하였다.
총3
반복의샘플링을통해2
배체와3
배체에서의기초발현수준을비교하였다.
둘째,
고수 온자극유도시, 2
배체대조군과3
배체그룹에서고수온에유 도되는HSP
유전자들의종류및각HSP
유전자의발현증가민 감도등에차등발현이관찰되는지여부를조사하기위해실험 적인고수온자극처리를실시하였다.
상기동일사육시스템내19±0.5ºC
에서혼합사육하고있는개체들을대상으로개체식별전자칩을이용하여유사한크기의
2
배체및3
배체개체들 을선발하여총6
개의실험수조(100 L; 19±0.5ºC)
를선발하여수조당
16
개체(2
배체및3
배체각8
개체)
씩을혼합수용하 였다.
실험수조환경에적응하기위해48
시간동안19±1ºC
에 서적응기간을거친후, 6
개실험수조중3
개의수조를대상으 로수온증가를유도하였다.
수온증가는자동온도조절기가연 결된300 W
석영히터를이용하여시간당0.5ºC
씩수온상승 을유지하였고,
고수온으로설정한30ºC
에도달후30±0.5ºC
에서24
시간항온으로유지하였다.
이때수온상승에의한용존 산소저감에효과를배제시키기위해서전기산소발생기를이용하여
19ºC
유지대조군과30ºC
고수온처리군의용존산소를
6.0±0.5 ppm
으로조절하였다.
실험군및대조군의수온과 용존산소는실험처리전기간동안매1
시간간격으로측정하 여확인하였다.
고수온자극처리직전및종료시점에서각반 복처리수조로부터2
배체6
미및3
배체6
미를샘플링하여아 가미와간췌장에서의HSP
유전자발현수준을분석하였다.
이때각개체별맨틀
(mantle)
의일부조직을샘플링하여유세포분석
(flow cytometry)
을통해배수성(ploidy level)
을재검증하 였다(Park et al., 2018).
핵산분리, 역전사 및 RT-qPCR assay
개체별아가미및간췌장조직으로부터
total RNA
를분리하 기위해서Tri-Reagent (Invitrogen)
을이용,
제조사의권고방 법에따라total RNA
를추출하였고,
이어추출한total RNA
시 료는RNeasy plus mini kit (Qiagen, Hilden, Germany)
을이용하여
DNA
제거과정을포함한순수분리과정을거쳐최종total RNA
시료를확보하였다.
각total RNA
시료를대상으로Nano Drop (ND-1000; Thermo Fisher Scientific, Waltham,
MA, USA)
을이용하여260 nm, 280 nm
및230 nm
에서흡광 도를측정하여1.9
이상의260/280 nm
및260/230 nm
흡광도비율을갖는
total RNA sample
들만을선발하여 역전사반응에이용하였다
.
역전사반응은Qiagen
사의Omniscript RT kit
를이용하여 제조사의권고방법대로oligo-d(T)
20프라이머와random nonamer
프라이머를9:1
비율로혼합하여cDNA
합성 을수행하였다.
합성된cDNA
는멸균증류수를이용하여10
배희석후각증폭반응당
2 μL
씩을주형으로이용하였다.
실시간PCR
반응은Light Cycler 480
시스템(Roche Applied Science, Penzberg, Germany)
및2X SYBR mater mix (Roche)
를이용하여유전자증폭산물의변동을
45 cycles
에걸쳐검출하였으며
,
이후melting curve
조사를통해서유전자별단일증폭 산물이특이적으로증폭되었음을확인하였다. cDNA
의serial log-dilution
샘플을이용한표준곡선(standard curve)
작성을 통해각유전자증폭에사용된primer pair
의PCR efficiency
가90-105%
범위에속함을검증하였고,
각유전자의PCR ef- ficiency
값과threshold cycle (Ct)
값을이용하여상대정량분석(delta CT
및delta-delta CT)
을실시하였다.
각조직내HSP
유전자들간상대발현수준의비교및각
HSP
유전자의온도자극처리에따른차등발현수준을비교하기위해서상기합성한
cDNA
주형들을이용하여, reference
용후보housekeeping
유 전자들을대상으로geNorm software package (Hallemans et al., 2007)
에의한발현안정성을평가한결과, normalization
효 과가가장우수하다고판정된ribosomal protein L7 (RPL7)
유 전자(Lee and Nam, 2016; Lee et al., 2019)
를reference
유전자 로선정하여각cDNA sample
별HSP
유전자들의발현수준을Table 1. Information on the HSP genes selected and PCR primers for RT-qPCR assay used in this study
Gene symbol Gene ID/Scaffold Primer sequence (5´-to-3´)
HSP90 HDSC00143CG00040/ HDSC00143 FW: TTGACGAGTACTGTGTCCAG
RV: ACCAGACGATTGGAAACCAC
HSP70 HDSC00042CG00040/ HDSC00042 FW: GGATCGACCCGTATTCCTAA
RV: TCCTGCTGTCTCAATGCCAA
HSIP70 HDSC00653CG00030/ HDSC00653 FW: AGAAAGCTCTGCGAGATGCT
RV: CAGAACATCCTTGATGGCGT
HSPBP1 HDSC02831CG00020/ HDSC02831 FW: TTGGCATGATTGACCAGCTG
RV: ACCTTCACAGACTCACCTGA
HSP70-12A HDSC06051CG00020/ HDSC06051 FW: GAGTCAGCCACATTGCAGTA
RV: AGCTTACTGGATGGATGACG
HSP60 HDSC04352CG00030/ HDSC04352 FW: AACCCCTTCTCATCATCGCT
RV: GATGTCCTCCAGCTTGTACA
HSP40 HDSC01574CG00060/ HDSC01574 FW: TTTCGGAGGTCCAAGTATGC
RV: CAAGTGACACCTGTAGGTCT
HSP, heat shock protein; PCR, polymerase chain reaction; FW, forward primer; RV, reverse primer. Gene IDs/Scaffolds annotated from the Haliotis discus hannai genome assembly are referred to Nam et al. (2017) and Kyeong et al. (2020). HSPBP1 gene is also referred to Park et al. (2018).
박철지
ㆍ
김은정ㆍ
남윤권518
normalization
하였다(Schmittgen and Livak, 2008). cDNA
별technical replication
으로서3
반복증폭실험을통해median Ct
값을취하여유전자발현분석에이용하였다.
통계처리
HSP
유전자들의조직내발현수준평가및2
배체-3
배체간HSP
유전자들의발현수준차이에대한평가는Student t-test
분석또는One-way ANOVA
분석을이용P=0.05
수준에서유 의성검정을수행하였고, ANOVA
분석결과의경우Duncan’s multiple range test
를이용하여평균값의분리를실시하였다.
결 과
2배체와 3배체간 HSP 유전자들의 기초발현 수준 Normalization control
로사용한내재유전자RPL7
유전자 의발현 수준은2
배체와3
배체간유의적인 차이가관찰되지 않았다(data not shown). 19ºC
수온조건에서샘플링한2
배체 의아가미에서HSP
유전자들의기초발현수준을평가한결 과, HSP90
이가장높은발현량을그리고이어서HSP70
이두 번째로 높은발현량을 나타내었다.
나머지유전자들이 경우HSP70-12A, HSP40
및HSP60
순으로발현수준이관찰되었 고, HSPBP1
및HSIP70
유전자들이가장낮은발현량을나타 내었다(P<0.05). 3
배체에서도상기2
배체에서의발현패턴과유사한경향을나타내어
3
배체아가미조직내HSP
유전자들의상대발현량의순위에는차이가없는것으로관찰됨으로써
, 3
배체에서도역시
HSP90
이가장높은발현량을그리고HSPBP1
및
HSIP70
이가장낮은발현수준을보였다.
그러나각HSP
유전자별2
배체및3
배체그룹간발현량을비교시분석한7
개HSP
유전자들모두에서3
배체가높은발현수준을나타내는경향을보였으며
,
이중HSP90
및HSP40
을제외한5
개HSP
유전 자들에서통계적인차이가관찰되었다(P<0.05).
통계적유의차 가인정되는5
개의HSP
유전자들은2
배체의평균값과비교시3
배체에서의1.3-2.6
배높게나타났고,
이중HSP60
에서2
배체 와3
배체간가장큰차이를보였다(Fig. 1A).
간췌장에서의
HSP
유전자들의발현분석결과,
이배체의경 우역시HSP90
및HSP70
이상대적으로다른HSP
유전자들에 비해월등히높은발현량을나타낸다는점,
그리고이들두유전자에이어서
HSP70-12A
가높은발현수준을보인다는점에서아가미에서의발현결과와유사하였다
.
반면,
다른HSP
유 전자들의경우,
아가미와달리간췌장에서는HSIP70
유전자가HSP40, HSP60
및HSPBP1
보다유의적으로높은발현을나타 내는차이가관찰되었다(P<0.05). 3
배체간췌장내HSP
유전자 들의기초발현경향역시HSP90/HSP70
이매우높은발현을,
그리고HSPBP1, HSP40, HSP60
에서상대적으로낮은발현을 보인다는점에서2
배체에서의결과와유사하였으나, 2
배체와 달리3
배체의경우HSIP70
의유전자발현이HSP70-12A
보다더높게나타나차이가있었다
.
한편,
각HSP
유전자별2
배체와3
배체간기초발현수준을비교한결과,
분석한7
개의유전자중아가미에서와마찬가지로
HSP90
및HSP40
에서는유의적 인차이가없었고(P>0.05),
그외추가적으로HSP70
유전자역 시간췌장에서는통계적인유의차가인정되지않았다(P>0.05).
나머지
4
개유전자중HSIP70, HSPBP1
및HSP60
에서는3
배 체가2
배체에비해3.6-6.3
배높은기초발현수준을나타낸반 면, HSP70-12A
의경우2
배체가3
배체에비해10
이상의높은 기초발현수준을나타내었다(P<0.05) (Fig. 1B).
아가미에서 2배체와 3배체들간 고수온 자극에 대한 HSP 유전자들의 차등 발현
2
배체및3
배체모두에서고수온자극처리에의해HSP
유전 자들의다양한유도발현양상이관찰되었으며,
각HSP
유전자 별로유도발현의민감도및fold change
값에큰차이를나타내(A)
(B)
1 10 100 1000 10000
H SP 90 H SP 70 H SI P7 0 H SP BP 1 H SP 70 -1 2A H SP 60 H SP 40
Relative mRNA expression levels of HSP genes (normalized against RPL7)
*
* *
*
*
a a
b c
d f e
u u
w v x z y
Diploid (2N) Triploid (3N)
1 10 100 1000 10000
H SP 90 H SP 70 H SI P7 0 H SP BP 1 H SP 70 -1 2A H SP 60 H SP 40
Relative mRNA expression levels of HSP genes (normalized against RPL7)
Diploid (2N) Triploid (3N)
*
*
*
* b a
d c
e g f
v x v w
y
z z
(A)
(B)
0 20 40 60 80 100 120
H SP 90 H SP 70 H SI P7 0 H SP BP 1 H SP 70 -1 2A H SP 60 H SP 40
*
*
Fold change of
expression relative to 19
°C-control group
Diploid (2N) Triploid (3N)
0 1 2 3 4 5
HSPBP1 HSP70-12A HSP60 HSP40
* *
1 10 100 1000 10000 100000
H SP 90 H SP 70 H SI P7 0 H SP BP 1 H SP 70 -1 2A H SP 60 H SP 40
Relative mRNA expression (normalized against RPL7)
Diploid (2N) Triploid (3N)
*
* * *
a a b
c c e d
v w w
x x y z
(A)
(B)
0 200 400 600 800 1000 1200 1400 1600
H SP 90 H SP 70 H SI P7 0 H SP BP 1 H SP 70 -1 2A H SP 60 H SP 40
*
*
Fold change of *
expression relative to 19
°C-control group
Diploid (2N) Triploid (3N)
0 5 10 1520 25 30
HSP90 HSP70 HSP70 -12A HSP40
1 10 100 1000 10000 100000
H SP 90 H SP 70 H SI P7 0 H SP BP 1 H SP 70 -1 2A H SP 60 H SP 40
*
*
*
a b c
d e e
f
z zy x
w x
w
Relative mRNA expression (normalized against RPL7)
Diploid (2N) Triploid (3N)
* *
Fig. 1. Basal mRNA expression levels of selected heat shock re- sponse genes at 19ºC in the gill (A) and hepatopancreas (B) of dip- loid and triploid abalone Haliotis discus hannai juveniles. Within a given ploidy group, means with different letters (a-g in 2N and u-z in 3N) are significantly different based on ANOVA followed by Duncan’s multiple range tests at P<0.05. Also within a given HSP gene, statistical difference between diploid and triploid groups is indicated by asterisk based on student’s t-test at P<0.05. HSP, heat shock protein.
전복 2배체 및 3배체에서 주요 HSP 유전자들의 발현
519
었다
. 2
배체의경우RPL7 normalization
을토대로19ºC
유지군의경우앞서시행한기초발현수준평가와비교시
HSP
유전자발현수준의순서및상대발현수준에서큰차이를나타 내지않았다
.
반면30ºC
로수온상승그룹의경우19ºC
항온유지군에비해서
HSP
유전자별로다양한폭의유도발현수준이관찰되었는데
30ºC/19ºC fold change
값을기준시, HSIP70 (> 80-fold)
에서가장많은변화가유발되었고,
이어서HSP90 (22.5-fold)
및HSP70 (17.8-fold)
에서많은발현수준의변화가 관찰되었다(P<0.05).
나머지HSP40, HSP70-12A
및HSPBP1
유전자의경우1.5-fold
에서4.0-fold
의비교적소폭의유전자 발현증가를나타내었으며(P<0.05),
다른HSP
유전자들과는달리
HSP60
의경우이배체아가미에서고수온자극에의한유의적인발현의증감은관찰되지않았다
(P>0.05) (Fig. 2A).
3
배체의경우고수온자극에의해HSIP70, HSP90
및HSP70
이 다른
HSP
유전자들에 비해 상대적으로 많은 폭의fold
change
변화가관찰된다는측면에서2
배체에서의발현패턴과유사하였다
(P<0.05).
그러나3
배체의경우2
배체에서고수온에발현의증가를나타낸바있는
HSP70-12A
가3
배체에서는오히려발현이감소되는결과를보인다는점
(P<0.05),
그리 고2
배체에서는고수온자극에발현의변화가없는HSP60
유 전자가3
배체에서는동일고수온자극에대해서4
배에가까운 발현증가를나타낸다는점에서2
배체와뚜렷한차이를보였 다(P<0.05) (Fig. 2A).
각
HSP
유전자별fold change
값에관한2
배체와3
배체간차 이를비교할경우HSP90, HSPBP1
그리고HSP40
에서는유의 적인차이가없었으나HSP70 (2N vs 3N=18-fold vs. 10-fold)
및HSIP70 (89-fold vs. 32-fold)
에서2
배체가3
배체에비해 유의적으로높은유도발현민감도를나타내었다(P<0.05).
이에기초발현수준을반영한고수온자극시최종발현양
(end-
point expression level)
을HSP
유전자별로2
배체와3
배체를비 교할경우,
역시HSP90, HSPBP1
그리고HSP40
에서는고수 온자극이후2
배체와3
배체가유사한발현수준에도달하는 것으로나타났으며(P>0.05), HSP70 (2N/3N ratio=1.4-fold), HSIP70 (1.8-fold)
및HSP70-12A (4.6-fold)
에서는고수온자 극에의해2
배체가3
배체에비해더높은발현량을최종나타 내었다(P<0.05).
반면HSP60
의경우3
배체가기초발현수준 이2
배체에비해더높았음에도(2.6-fold)
불구하고고수온자 극시3
배체특이적인유도발현을나타냄으로써고수온처리이 후2
배체와3
배체간발현수준의차이는더심화되었다(3N/2N ratio=9.5-fold) (P<0.05) (Fig. 2B).
간췌장에서 2배체와 3배체들간 고수온 자극에 대한 HSP 유전자들의 차등 발현
아가미에서와마찬가지로고수온자극에의해간췌장에서도
HSP
유전자별다양한fold change
값이관찰되었고HSP
유전 자종류에따라2
배체와3
배체간유도발현의민감도및고수 온자극처리후최종도달유전자발현량에차이가관찰되었 다. 2
배체간췌장의경우고수온자극에의해가장큰폭의fold change
를나타낸유전자는HSIP70 (30ºC/19ºC ratio=1,200-
fold)
로써 급격한 발현 증가가 유도되었고, HSIP70
에 이어HSPBP1
역시 고수온처리에의해300
배 이상의발현증가가 관찰되었다
(P<0.05).
이들두HSP
유전자외에HSP90
및HSP70
에서약18-fold
에서20-fold
의발현증가가관찰되었으 며HSP40
및HSP60
의경우각각1.4-fold
및2.8-fold
의유전 자발현증가를나타내었다(P<0.05).
반면HSP70-12A
에서는 고수온자극에의해오히려발현이감소하는결과를나타내어 아가미에서의결과와차이를보였다(P<0.05). 3
배체의경우역 시HSIP70
및HSPBP1
에서높은유도발현을나타내었으나그fold change
값의증가폭이2
배체에비해서상대적으로낮았고(B)
1 10 100 1000
H SP 90 H SP 70 H SI P7 0 H SP BP 1 H SP 70 -1 2A H SP 60 H SP 40
Relative mRNA expression levels of HSP genes (normalized against RPL7)
* *
*
*
a a
b c
d f e
u u
w v x z y
1 10 100 1000 10000
H SP 90 H SP 70 H SI P7 0 H SP BP 1 H SP 70 -1 2A H SP 60 H SP 40
Relative mRNA expression levels of HSP genes (normalized against RPL7)
Diploid (2N) Triploid (3N)
*
*
*
* b a
d c
e g f
v x v w
y
z z
(A)
(B)
0 20 40 60 80 100 120
H SP 90 H SP 70 H SI P7 0 H SP BP 1 H SP 70 -1 2A H SP 60 H SP 40
*
*
Fold change of
expression relative to 19
°C-control group
Diploid (2N) Triploid (3N)
0 1 2 3 4 5
HSPBP1 HSP70-12A HSP60 HSP40
* *
1 10 100 1000 10000 100000
H SP 90 H SP 70 H SI P7 0 H SP BP 1 H SP 70 -1 2A H SP 60 H SP 40
Relative mRNA expression (normalized against RPL7)
Diploid (2N) Triploid (3N)
*
* * *
a a b
c c e d
v w w
x x y z
(A)
(B)
0 200 400 600 800 1000 1200 1400 1600
H SP 90 H SP 70 H SI P7 0 H SP BP 1 H SP 70 -1 2A H SP 60 H SP 40
*
*
Fold change of *
expression relative to 19
°C-control group
Diploid (2N) Triploid (3N)
0 5 1015 20 25 30
HSP90 HSP70 HSP70 -12A HSP40
1 10 100 1000 10000 100000
H SP 90 H SP 70 H SI P7 0 H SP BP 1 H SP 70 -1 2A H SP 60 H SP 40
*
*
*
a b c
d e e
f
z zy x
w x
w
Relative mRNA expression (normalized against RPL7)
Diploid (2N) Triploid (3N)
* *
Fig. 2. Differential expression of HSP genes in response to acute thermal challenge (elevation of water temperature from 19ºC to 30ºC) in the gill of diploid and triploid abalone Haliotis discus han- nai juveniles. (A) Fold changes of induced expression at the end of heat shock treatment relative to 19ºC-control group. (B) Rela- tive end-point expression levels normalized. In (A) and (B), aster- isks indicate the statistical difference between diploid and triploid groups based on Student’s t-test at P<0.05. In (B), within a given ploidy group, means with different letters (a-e in 2N and v-z in 3N) are significantly different based on ANOVA followed by Duncan’s multiple range tests at P<0.05. HSP, heat shock protein.