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식물 DNA 바코드 데이터 생산 및 연구 동향

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식물 DNA 바코드 데이터 생산 및 연구 동향 박인규 Page 1 / 13 BRIC View 2017-T05

식물 DNA 바코드 데이터 생산 및 연구 동향

박 인 규

한국한의학연구원 K-herb 연구단 E-mail: [email protected] 요약문 조류와 비행기의 잦은 충돌로 인해 조류의 종 동정이 절실해졌고, 이런 숙제를 해결하기 위해 DNA 바코드라는 개념이 고안되었다. 생물 종의 동정 및 분류의 정확성을 높이기 위해 DNA 바코드 분석이 가능하다. 기존의 범용성 DNA 바코드(ITS, matK, rbcL, trnL-F)는 식물 종 동정에 중추적 역할을 하고 있다. 뿐만 아니라, 차세대 염기서열 분석(Next Generation Sequencing)이 등장함에 따라 엽록체 유전체 전체 수준에서 분석이 가능하게 되었고, DNA 바코드의 정확성이 향상되는 기여를 하였다. DNA 바코드 데이터베이스는 BOLDSYSTEM과 GenBank가 대표적인 데이터 베이스이며, 이들을 활용한 DNA 바코드 분석이 가능하다. 국내에서도 분야별 이용 가능한 데이터베이스를 구축했거나 진행 중이며, 이러한 DNA 바코드 데이터베이스는 생명 정보의 꽃으로서 DNA 바코드 관련 분야에 큰 역할을 할 것으로 기대된다.

Key Words: DNA barcode, Core DNA barcode, ITS, matK, rbcL, trnL-F, Chloroplst genome, DNA

barcode database, BOLD, GeneBank

목 차

1. 서론 2. 본론 2.1 DNA 바코드 2.2 DNA 바코드 종류 2.2.1 Universal DNA 바코드 2.2.2 NGS 기반 신규 Super DNA 바코드 발굴 2.3 DNA 바코드 응용 분야 2.3.1 최근 DNA 바코드 활용 BRIC View 동향리포트

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(1) 종 감별 및 한약자원 동정

2.4 DNA 바코드 데이터 베이스 국내외 현황 2.4.1 BOLD & NCBI

2.4.2 GeneBank 2.4.3 국내 DNA 바코드 DB 구축 현황 3. 결론 4. 참고문헌

1. 서론

전 세계적으로 약 300,000종의 식물 종(species)이 동정(identification)되어 있다[1]. 하지만 여전히 많은 종의 동정이 명확하지 않다. 종의 정확한 분류(classification)와 동정은 분류학자들에게도 여전히 중요한 도전 과제이다. 이러한 종 동정이나 분류의 정확성을 높이기 위해 활용되는 것이 바로 DNA barcode이다. DNA barcode란 일종의 ID를 부여하는 것으로 종간 특정 DNA 염기서열의 차이를 이용하며, 이를 통해 종을 구분할 수 있다. 특히, 생물다양성협약 (Convention on Biological Diversity, CBD)에서는 생물다양성 관리에 있어 DNA 바코드 방법이 유용하게 사용될 수 있음에 동의하고 있으며, 적극 권장하고 있다. 간단한 분자생물학적 DNA 분석 기술만 알고 있거나, 종의 염기서열을 보유하고 있다면, 현존하는 DNA 바코드 데이터베이스를 이용하여 DNA 바코드 분석이 가능하며 종 동정이 가능하다. 최근 모든 생물 세포에서 DNA의 추출이 가능함에 따라 DNA 바코드 기법이 다양한 분야에 활용되고 있다. 생체 시료이거나 표본, 약재 동물의 배설물 및 식물의 뿌리, 가공 식품 등에서 DNA를 추출하여 생물 검증이나 종 구별 등 다양한 분야에서 적용 및 응용이 가능하다. 본 리포트는 식물 종 동정이나 분류에 사용되고 있는 DNA 바코드와, DNA 바코드를 이용한 연구 동향 및 DNA 바코드 데이터베이스에 대해 기술해보기로 한다.

2. 본론

2.1 DNA 바코드

DNA 바코드는 일종의 유전자 신분증(ID)으로 생명체가 가지고 있는 고유의 염기서열 정보를 이용하여 다른 종과의 차이를 나타낼 수 있으며, 이러한 종 판별에 사용되는 유전자 영역을 DNA 바코드라 한다. DNA 바코드의 시작은 2003년 궬프대학의 Paul Hebert의 연구 그룹에서 발간한 “Biological identifications through DNA barcodes”를 통해 알려졌다[2]. 그들은 genome의 보편화된 지역의 DNA 단편을 사용하여 종 동정 및 분류가 가능한 새로운 시스템을 제안하였다. DNA 서열은 다른 종을 식별하는 데 사용될 수 있으며, 이것은 마치 슈퍼마켓 스캐너로 구매하고자 하는 물건의 바코드를 사용하여 스캔하여 계산하는 것과 같은 것이다. 현재 DNA 바코드는 전 세계적으로 여러 분야에 활용되고 있는 분자생물학적 기법 중 하나이다(그림 1).

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그림 1. DNA 바코드 개념

2.2 DNA 바코드 종류

2.2.1 Universal DNA 바코드

식물에서 사용하는 바코드는 주로 범용성 핵심 바코드(core DNA barcode)로서 주로 식물

엽록체에 존재하는 matK, rbcL, trnH-psbA(그림 2)와, 45S rDNA에 존재하는 ITS(그림 3)가 있다.

마이토콘드리아에 존재하는 CO1 (cytochrome oxidase 1)은 주로 동물의 범용성 바코드로 사용되고 있다.

MatK (Maturase K)는 엽록체에 존재하는 유전자로 높은 evolutionary rate를 가지고 있다[3].

또한 낮은 transition/transversion rate와 이종(Interspecies) 간의 variation이 있으며, conserved한 염기서열을 가지고 있어 core DNA barcode로 사용되고 있다. CBOL plant working group은 2009년 한 세트의 프라이머를 이용하여 angiosperm의 90%에서 amplify된 것으로 나타났다. Lahaye et al

(2008)는 specific primer를 제작하여 1,667개의 angiosperm 100% amplify하였다[4]. MatK 유전자는

길이가 길고 amplify의 어려움과 종간 서로 다른 discrimination rate를 보이는 단점을 갖고 있어 다른 DNA 바코드와 결합하여 사용하길 추천한다[5].

rbcL (ribisco Large) 역시 식물 엽록체에 위치하는 유전자로서 genebank에 50,000개 이상의

sequence가 확보하고 있으며, phylogenic analysis에 널리 사용되는 DNA 바코드이다[6]. Family와 genus 수준에서 사용되는 DNA 바코드로서 amplify가 잘 되며, land plant 대부분에서 sequence가 존재하고 align이 쉽다. 하지만 식물에 존재하는 유전자 중에 divergence가 가장 낮고 분화가 느린 유전자이며, species 수준의 DNA 바코드로 활용하기 어렵다[7,8]. 그럼에도 불구하고 여전히 범용성

DNA 바코드로 사용되고 있으며, rbcL과 다른 DNA 바코드와의 조합으로 DNA 바코드로서 사용되고

있다.

trnH-psbA (transfer RNA gene – photosystem II protein D1 gene)의 intergenic 구간은 최근에 가장 많이 사용되는 DNA 바코드이다. 상당히 conserved한 유전자 영역을 기반으로 바코드

primer 제작이 가능하기 때문에 대부분의 속씨식물에서 적용이 가능하다[9,10]. trnH-psbA는

유전자와 유전자 사이인 intergenic 구간이기 때문에 sequence divergence가 다른 지역보다 상당히 높다. Insertion/deletion이 많이 일어나는 지역이기 때문에 이를 기반으로 DNA 바코드를 제작할 수

있으며, 여러 식물군의 분류를 통해 trnH-psbA가 비교적 안정적인 DNA 바코드로 나타났다[9,11-13].

ITS (Internal transcribed spacer)는 식물의 Ribosomal DNA (rDNA)는 multi-copy형태로

존재하며, intergenic spacer (IGS) 길이 종내 혹은 종간 변이를 나타낸다[14]. Flowering plant의 45S

ACGAGTCGGTAGCTGCCCTCTG ACTGCATCGAATTGCTCCCCTAC TACGTGCTATATGCGCTTACGAT CGTACGAAGATTTATAGAATGC

DNA Barcode

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rDNA는 5.8S, 18S, 25S rDNA와 5.8S 양 옆에 위치한 internal transcribed spacer (ITS1, ITS2)를

포함한다(그림 3). ITS는 plant DNA barcode의 대표적인 구간으로, plastid에 존재하는 다른 DNA 바코드 보다 low taxonomic 수준의 분류가 가능하며, 널리 사용된다. 하지만 CBOL Plant working group 2009에서 ITS를 supplementary locus로 간주하고 있다[6,15,16]. 그 이유는 불안정한 concerted evolution과, fungal contamination, amplify와 sequencing의 문제가 있기 때문이다. 하지만 2011년, China Plant BOL group에서 ITS를 Plant core barcode로 간주하였다. 위에서 언급한 ITS의 단점을 보완하고자 ITS2를 개발하였고[17-20], amplify와 sequencing의 문제를 줄일 수 있었다. 현재 ITS2는 새로운 핵심 범용성 DNA 바코드로 사용되고 있다.

Core DNA 바코드뿐만 아니라 엽록체 기반의 다양한 바코드 마커가 개발되어 사용되고 있다.

대표적으로 ndhF, rpoB, rpoC1, atpF-atpH, psbK-psbI, ycf1, ycf5 등이 있다. 식물의 DNA 바코드 분석

시 single locus의 variation으로 DNA 바코드로서 충분한 능력을 보이기 어려운 경우도 많다. 따라서

보다 효율적인 multi-locus method를 제안하고 있다[21]. 이를테면, rbcL+tenH-psbA[11],

rpoC1+rpoB+matK, rpoC1+matK+tenH-psbA, matK+atpF-atpH+trnH-psbA[22]와 같이 여러 부분의 DNA 바코드를 조합하여 종간 구분 지을 수 있다는 것이다. 특히, CBOL Plant Working Group (2009) 은 matK+rbcL 바코드를 함께 분석하는 것을 추천하고 있다[16].

그림 2. Circular gene map of the Aconitum species* 엽록체 genome 내에 존재하는 범용성 core DNA barcode 위치

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그림 3. Ribosomal DNA array and ITS position

2.2.2 NGS 기반 신규 Super DNA 바코드 발굴

현재 분자생물학적 기법의 발달과 NGS (next generation sequence)의 등장으로 기존의 Sanger 방식보다 저렴하고 효율적인 전체 유전체 분석이 가능해졌다[23]. DNA 바코드 역시 NGS를 이용한 발굴 작업이 수행되고 있으며, 대부분 엽록체 분석을 통해 이루어진다. 엽록체는 식물이 살아가는데 중요한 역할은 하는 기관 중 하나이다(그림 2). 엽록체의 유전체 길이는 120–180 Kb이며, 두 개의 single copy (LSC 와 SSC)와 두 copy의 inverted repeat (IR)으로 구성되어 있다. 유전자는 110–130개가 존재하며, 약 80여개의 protein coding gene과 4개의 rRNA, 30여개의 tRNA로 구성되어 있다. 엽록체 genome은 계통 분류에 많이 사용되고 있으며, 종 동정을 위한 마커 개발의 기반이 되기도 한다. 몇 백 base pair 수준의 일부 구간을 활용했던 기존의 바코드의 단점과 제약적 문제점을 보완하고자 엽록체 전체 genome분석을 통해 백 kb 이상의 염기서열을 확보할 수 있게 되었고, 이들의 정보를 활용한 DNA 바코드 분석이 가능하게 되었다. 엽록체 genome을 통해 보다 빠르고 쉽게 종간 variation을 찾을 수 있으며, 이들을 일컬어 Super-barcode라 한다. 기존의 범용성 DNA 바코드보다 상당히 많은 정보를 얻을 수 있기 때문에 종 동정 및 분류뿐 아니라 그것의 정확성에 큰 기여를 하고 있다. 엽록체 genome들의 비교 분석을 통해 기존의 범용성 DNA 바코드뿐만 아니라 genome들간 variation을 확인하며(그림 4), 이를 이용한 마커 개발이 가능하다(그림 5). 하지만, 기존 DNA 바코드에 비해 비용과 시간이 많다는 단점이 있다. 또한 여러 종의 엽록체 genome이 비교 분석이 필요하며, 개발된 마커는 amplify의 가능성과 확대 종의 적용 가능 여부에 대한 검증 절차가 필요하다.

18S

25S

18S

5.8S

ITS1 ITS2

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그림 4. 신규 DNA 바코드 발굴을 위한 8종의 Aconitum species의 전체 엽록체 genome의 variation 비교 분석(mVISTA 프로그램 이용), 하얀 부분은 sequence variation.

그림 5. 엽록체 genome 기반 신규 DNA 바코드 및 감별 species-specific SCAR 마커 개발

2.3 DNA 바코드 응용 분야

2.3.1 최근 DNA 바코드 활용

DNA 바코드는 종의 동정 및 분류뿐만 아니라 다양한 분야에 사용된다. 지적 재산권 확인, 새로운 야생 생물의 동정, 고유종의 판별, 생태학적 연구, 법생물에서 범죄와 연관된 생물학적 증거와 자료 규명, 검역 대상 생물 종 검정, 식품 안정성 확인 및 품질 관리 등 사회 분야 전반에 걸쳐 DNA 바코드가 사용되고 있다. 그 중 아래 예시는 한국한의학연구원에서 수행 중인 DNA 바코드를 이용한 한약 자원 종 감별 및 유사품 종 단위 동정에 대해 소개하도록 한다. M1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1 M 2 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 131 bp

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(1) 종 감별 및 한약자원 동정

안정적 한약자원 확보 기술 개발의 일원으로 한약 자원 종 감별 기술 개발을 수행 중에 있다. 한약재 및 한약 자원은 대부분 수입에 의존하며, 야생 채취 및 관행 재배와 생산량의 부재로 인해 혼 오용되어 유통되고 있는 실정이다. 이러한 문제점을 해결하고자 DNA 바코드 분석을 통해 한약 자원 식물의 종 동정 및 분류와 유통 약재의 모니터링을 수행 중에 있다(그림 6). 관계 기관인 대검찰청과 연계하여 가짜 백수오 유전자 감식에 필요한 백수오, 이엽우피소, 당귀, 천궁 등의 한약 자원 표준 표본 공유와 유전자 감별 기술 지원을 통한 사회문제 해결에 활용되고 있다. 뿐만 아니라 한국 DNA 법생물 연구회(한국한의학연구원, 대검찰청, 농산물품질관리원, 관세청, 농촌진흥청 등 14개 국가기관 참여)를 발족하여 한약재뿐만 아니라 농축수산물에 대한 유전자 감별법 정보 공유 및 협력 네트워크 구축하고 있다. 한약재의 혼 오용 방지 및 기원 정립을 위한 표준 한약 자원 관련 정보와 분류학적 기원 종 동정을 위한 한약 자원 DNA 감별 시스템 구축으로 유사 한약재 유통 방지를 위한 기술 및 공공 인프라 제공 중에 있다. 한약재의 혼 오용 방지를 위한 DNA 기원 감별 시스템을 구축하여 종자, 기원 식물, 한약재 등을 종 단위에서 정확하게 감별함으로써 제2의 백수오 사태와 같은 한약자원 혼 오용 방지에 활용 중에 있다.

그림 6. Stragies for DNA barcoding and marker development

2.4 DNA 바코드 데이터 베이스 국내외 현황

2.4.1 BOLD & NCBI

DNA barcode는 Hebert(2003)가 세계 최초로 나비목(Lepidoptera)을 대상으로 DNA

Strategies for DNA Barcoding and Marker Development

Genetic Analysis

Universal DNA Barcode

Sample Preparation Specificity Verification 1. AAGGCTA 2. AAGGGTA 3. AAGGATG M DNA Purification Inter-specific Comparison SCAR marker NCBI BOLD Herbarium K-DNA DB link

KIOM DNA Barcode DB

Species Identification Yes No Species Identification Yes link

Multiplex-SCAR and Monitoring

Establishment of DB

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barcoding 기법을 도입한 이래 현재까지 전 세계적으로 동 식물, 미생물 전반에 걸쳐 다양한 분류군에서 활발히 연구가 진행되고 있다[2]. 이처럼 DNA barcode 중요성이 높아짐에 따라 국제적으로 컨소시엄이 구성되었으며, 대표적으로 2004년에 설립된 CBOL (Consortium for the Barcode of life; http://www.barcodeoflife.org)을 들 수 있다. CBOL은 50개국의 200여개 기관으로 구성된 협력체다. 현재, 보유하고 있는 sequence는 6,128,995개의 sequence를 보유하고 있으며, 바코드 관련 sequence는 5,301,123개이다. 동물이 175,796개, 식물이 65,605개, Fungi와 기타 생물에 관련하여 20,830개를 보유하고 있다. CBOL과 연계하여 2010년 25개국 대표들이 결성된 비영리목적의 DNA 바코드 컨소시엄인 iBOL (International barcode of life; http://www.ibol.org)이 설립되었다. iBOL은 지구상에 존재하는 약 50만종의 생물 DNA barcode library를 구축하였다. 이를 연계하여 생산된 정보는 BOLDSYSTEM (http://www.boldsystems.org/)에 실시간 업로드하여 바코드 정보를 공유할 수 있도록 하였다(그림 7).

그림 7. BOLDSYSTEM과 GenBank의 홈페이지

2.4.2 GeneBank

GenBank (NIH Genetic sequence database; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)는 DNA 바코딩 분석의 매우 중요한 역할을 하는 데이터베이스이다. GenBank는 EMBL (European Molecular Biology Laboratory)과 DDBJ (DNA Data Bank of Japan) 함께 INSDC (International Nucleotide Sequence Database Collaboration)를 구성하였다. 본 협력체는 바코드 데이터 저장을 위한 영구적으로 공개된 데이터베이스이다(그림 7). GenBank는 누구나 접속 가능하며, 공개적으로 이용 가능한 DNA sequence와 그것의 Protein sequence를 annotation하였다. GenBank는 INSDC의 한 부분이며, NCBI (National Center for Biotechnology Information)에서 제작되었다. 협력을 통해 전 세계의 약 10만 종 이상에서 이들의 sequence를 확보하고 있다. 현재 바코드로서 등록된 sequence는 동물 1,633,036개, 식물 76,602개, fungi 10,250개, Protists 15,222개, bacteria 2027개의 sequence를 보유 중이다.

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2.4.3 국내 DNA 바코드 DB 구축 현황

우리나라의 DNA 바코드 정보는 인프라 미흡, 생물 정보의 부족 및 정보 활용의 부재로 인해 선진국에 비해 부족한 생물 정보를 보유하고 있다. 보다 많은 정보를 발굴하고 활용하기 위한 노력이 필요하다. 현재 우리나라의 DNA 바코드 데이터 베이스 구축되었거나 진행 중인 곳이 아래와 같다(표 1). 부처별 생명 정보 확보 및 인프라 구축이 진행되고 있으나, DNA 바코드 정보의 양은 매우 적은 실정이다. 또한 관련 연구별 각 기관들이 관련 데이터 베이스 구축을 진행하고 있어 효율성이 떨어지고 있는 실정이다. 식물 관련 DNA 바코드 관련 구축되었거나 구축 중인 데이터베이스에 대해 기술 하였다. 표 1. 국내 식물 DNA 바코드 관련 데이터베이스 데이터베이스 주소 주관 기관 한반도의 생물다양성 https://species.nibr.go.kr/index.do 국립생물자원관 국가생명연구자원통합정보시스템 https://www.kobis.re.kr/ 국가생명연구자원정보센터 국가생물다양성 정보공유체계 https://www.kbr.go.kr/ 국가생물다양성센터 법생물 DNA 데이터베이스 오픈 예정 대검찰청 K-herb DNA 데이터베이스 오픈 예정 한국한의학연구원 한반도의 생물다양성 데이터베이스(NIBR)는 국가 생물자원의 효율적 보전 및 관리 시스템을 구축하고자 데이터베이스를 개설 하였다(그림 8). 한반도에 존재하고 있는 다양한 생물 종의 표본 및 3,358건의 유전정보를 보유하고 있다. 국가생명연구자원통합정보시스템(KOBIS)은 국가 생명연구자원과 관련된 공개 자료의 체계적인 수집 및 관리를 위해 구축되었으며, 국민이 생명연구 자원정보에 쉽고 빠르게 접근할 수 있는 검색 및 탐색 기능을 지원한다. 국가 생물 다양성 공유 체계 데이터베이스(KBR)는 생물다양성협약(CBD)에 의거하여 구축된 데이터 베이스로서, 우리나라의 생물 종 정보를 통합 관리하고 있다. 현재 DNA 정보 32,513건이 등록되어있다. 최근 법생물 DNA 데이터 베이스가 구축되었다는 소식을 전했다. 부정 및 불량 식품범죄, 신종마약범죄 등에 적극 대응하기 위해 데이터베이스를 구축하였다. 동∙식물 및 미생물 포함 약 1억 8000만개의 DNA 바코드를 보유하고 있으며 DNA 과학수사에 활용하고 있다. K-herb DNA 데이터베이스는 한약 자원의 수입 증가와 원산지 속임 증가에 따른 사회적 관심이 증대하고 있어 국내외 한약 자원의 정확한 유전학적 근거를 제시할 필요성이 높아지고 있어 구축하게 되었다. 또한 한국한의학연구원이 보유하고 있는 한약 자원 표본 정보(http://boncho.kiom.re.kr/herbarium) 17,000여 점과 연계된 DNA 바코드 데이터 등록 및 분석이 가능하다(그림 9).

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식물 DNA 바코드 데이터 생산 및 연구 동향 박인규 Page 10 / 13 그림 8. 한반도의 생물다양성, 국가생명연구자원통합정보시스템(KOBIS), 국가생물다양성 정보공유체계, K-herb DNA 데이터베이스 그림 9. DNA 바코드 기반 한약자원 유전자 마커 개발 및 감별시스템 구축 Medicinal Resources DNA Barcode DB Researcher Quality Inspection NCBI BOLD Public DB Herbarium KIOM KIOM DB lin k link Industry Application of DB

Analysis DNA Barcode DB

Pharmacist Government ᆞ ᆞ ᆞ ᆞ

Authentication Herbal Medicines

K-herb DNA Authentication System

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3. 결론

DNA 바코드는 종의 분류 및 동정, 계통 체계 구축에 큰 기여하고 있다. 그뿐만 아니라, 범죄 현장의 증거 분석, 환경유해생물 발견, 생물 종 검정, 고유종 등록, 신물질 재료 생물 검증 등 다양한 분야에서 DNA 바코드가 사용되고 있다. 앞으로 더 많은 영역에 DNA 바코드가 활용될 것이다.

DNA 바코드의 큰 목표 중 하나는 single locus의 sequence를 통해 종 동정을 가능하도록 하는 것이다. 하지만 수백 bp 수준의 sequence만을 가지고 종의 구분을 하려는 노력에 대해 상당한 제한이 존재한다. 특히, 충분치 않은 variation과 낮은 PCR 효율, 유전자 결실은 범용성 DNA 바코드로서 사용을 방해하는 요인 중 하나이다. 현재, sequence 분석이 발전함에 따라 생물 전체 염기서열 분석이 가능해 졌으며, 엽록체를 포함한 plastid 역시 가능하게 되었다. 특히, 밀접하게 관련된 종 분류에 큰 기여를 하고 있다. 특정 DNA 바코드를 사용한 종의 분류에서 Super DNA 바코드를 이용한 방법이 점점 늘어날 것이며, 더 발전할 것으로 전망된다. 필자의 생각은 범용성 DNA 바코드와 Super 바코드의 적절한 조합을 이용한 분석이 필요하며, 종에 맞는 기법을 적용하고 활용하는 것이 가장 합리적인 방법이 아닌가 생각한다. 지구상에 사는 종의 분류 및 동정에 DNA 바코드의 역할이 커짐에 따라 많은 정보를 보유하게 되었고 이러한 정보를 관리할 필요성이 있어 DNA 바코드 데이터베이스를 구축하게 되었다. 가장 대표적이고 많이 활용되는 BOLDSYSTEM, GenBank가 있으며 이런 데이터 베이스를 활용하여 시료나 DNA만 보유하고 있으면 종 동정 및 분류가 가능하다. 두 개의 데이터 베이스가 현존하는 DNA 바코드 데이터 베이스의 대표이며 앞으로도 중추적 역할을 할 것으로 생각된다. 국내 보유 DNA 바코드 데이터 베이스의 구축은 현재 시작 단계로 생각되며, 부처간 분산되어 구축되는 데이터베이스를 통합적이고 체계적인 관리로 사용자 중심의 데이터베이스가 구축되어야 할 것이다. 특히 전문가 활용 데이터베이스와 일반 데이터베이스를 구분을 지어 관리되어야 할 것이며, 데이터베이스의 활용적 측면을 많이 고민해야 할 부분이 아닌가 생각된다. 날로 발전하는 분자생물학적 기술의 적용과 함께 일반적으로 활용된 DNA 바코드를 함께 활용해야 할 것이며, DNA 바코드 데이터베이스가 가장 큰 역할을 할 것으로 기대된다.

4. 참고문헌

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식물 DNA 바코드 데이터 생산 및 연구 동향 박인규 Page 13 / 13

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※ 본 콘텐츠는 의 후원으로 작성되었습니다.

The views and opinions expressed by its writers do not necessarily reflect those of the Biological Research Information Center. 박인규(2017) 식물 DNA 바코드 데이터 생산 및 연구 동향. BRIC View 2017-T05

Available from http://www.ibric.org/myboard/read.php?Board=report&id=2686 (Feb 14, 2017) Email: [email protected]

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그림  1. DNA  바코드  개념  2.2 DNA  바코드  종류
그림  2.  Circular gene map of the Aconitum species*  엽록체  genome  내에  존재하는  범용성  core  DNA barcode  위치
그림  3. Ribosomal DNA array and ITS position  2.2.2 NGS  기반  신규  Super DNA  바코드  발굴
그림  4.  신규  DNA  바코드  발굴을  위한  8종의  Aconitum species의  전체  엽록체  genome의  variation  비교  분석(mVISTA 프로그램  이용),  하얀  부분은  sequence variation
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