학 습 목 표
1.계통분류학의 핵심기술을 이해한다.
2.PCR-Cloning-Sequencing-Phylogeney 인식한다.
3.계통분류도와 이종상동서열의 관계를 이해한다.
4.계통분류학의 현황과 전망을 고찰한다.
지난 시간 줄거리-1
1. 영장류의 진화과정동안, HERV-W=MSRV 및 HERV-K LTR family는 평행진화를 해 왔다.
2. 평행진화해 온 HERV-W는 다발성경화증 및 신경 정신분열증과 연루되어 있다.
3. 진화과정에서 잘 보존되어 온 cytochrome C유
전자의 분석으로 다양한 생물종을 계통분류할 수
있다.
지난 시간 줄거리-2
1. 향상진화(계통적 진화): 하나의 가계내에서 연속적인 변화를 보여 줌. 긴 시간동안 상대적으로 적은 표현형을 보여 준다.
2. 분지진화(계통적 가지치기): 하나의 가계내에서 하나 이상의 종이 나도록 분리. 긴 시간동안 명백하게 계통적 가지가 나뉜 다.
3. 진화를 야기시키는 핵심적인 파워는 gene duplication(유전자 중복)이다.
4. Insulator에 의해 유전자 발현이 조절된다. 시토신의 메틸레이 션 현상과 인핸서가 상호 연루되어 있다.
MEGA5 G C G
GENETYX PAUP
PHYLIP BioEdit
CLUSTAL-W
species
gene
Speciation Event
Duplication Event
GENE Duplication
gag pro
Hs13 24680 HsX 79639
Hs21 11669 1 Hs5 34934 Hs6 7456 1 Hs1 4716
Hs1 4843 Hs2 16082 Hs1 33153
Hs4 22948 Hs6 7579
Hs17 10940 Hs6 25897 2
Hs15 10351 2 Hs3 5769 1
Hs7 8090 1
Hs2 22340 2 Hs3 22673
Hs11 34082 Hs14 26604 Hs3 5769 2
Hs18 11016 Hs15 10351 1
Hs12 29578 2 Hs2 22340 1 Hs12 29578 1
HERV-9 pro
44 71
61
42
34
57 35 Hs11 34082
Hs6 7456 1 Hs6 25897 2 Hs17 10940
Hs3 22673 Hs1 4843
Hs1 33153 Hs1 4716 Hs18 11016
Hs14 26604 Hs5 34934 Hs21 11669 1 Hs2 22340 1
Hs2 16082 Hs3 5769 2
Hs13 24680 HsX 79639 Hs6 7579 Hs7 8090 1
Hs4 22948 Hs15 10351 1 Hs15 10351 2
Hs2 22340 2 Hs3 5769 1 Hs12 29578 1 Hs12 29578 2
HERV-9 gag 92
43 44 43
88 36
35 50 37
33
31
Human Chimpanzee
T I M
E
Evolutionary Time = Distance / 2 Rate
Evolutionary Rate = Distance / 2 Time
1. Neighbor-Joining method : 이웃연결방법
2. Maximum Parsimony method : 최대단순방법
3. Maximum Likelihood method : 최대가능방법
4. UPGMA : 비가중평균결합법
1. 분자생물학적 기술
- PCR에 의한 미량표본의 동정 - 염기서열 비교분석
- RFLP, DNA-DNA hybridization
2.
세포유전 및 생화학적 기술
- 염색체의 수나 구조를 다양한 분염법으로 분석 - FISH/PRINS기법으로 유전자 위치 추적
- 다차원 전기영동법 이용 3.
생물정보학적 기술
- 다양한 유전자정보 분석 프로그램 이용
-머리카락 -혈흔
-똥 -오줌 -정자
-구강세포
혈연관계 범인추적
그림위조방지
12
13
Normal Male HUMAN X Y Y Y Y
Orangutan X Gorilla X Chimpanzee X Y Gibbon X Gorilla X
멋 진 그 림
멋진 미래의 모습은 어떠한지 그림을 그려라.
현실적인 계획을 세워 그것을 달성할 수 있게 하라.
계획을 지금 이 순간 행동으로 옮겨라.
- 스펜서 존슨의 《선물》 중에서 -
* 좋은 밑그림이 먼저입니다. 밑그림이 좋아야 좋은 건물도 지어집니다.
다음은 구체적인 계획입니다. 그러나 더 중요한 것은 실천력입니다.
좋은 밑그림도, 계획도, 행동으로 옮기는 실천력이 없으면 허사입니다.
학습 요약 정리
1.PCR: 반응액(주형DNA, dNTP, primers, Taq DNA
polymerase)을 94C로 가열하여, 주형DNA를 single strand 로 한다. 55C로 냉각하여 primers를 표적배영 양단에 결합 시킨다. 72C로 가열하여, Taq DNA polymerase가 주형 DNA로부터 상보적인 새로운DNA사슬을 합성한다.
2. PCR products에 대한 염기서열을 분석하고, phylogeny tree (NJ, MP, ML)를 만든다.
3. Phylogeny tree는 이종상동서열(orthologous
sequences)을 이용한다. 정확한 tree완성시에는, 유사서열 (paralogous sequences)을 사용해서는 안된다.
