구역화영상을 합치고 테두리 속에 빛깔을 채움

Fig. 33. Comparison of outline thickness in the segmented image with TIFF format.

Thickness is 2 pixel (left); thickness is 10 pixel (right).

어느 구조물을 포함한 모든 구역화영상을 한 폴더에 담았다(Table 3). 보기를 들어서 피부를 포함한 모든 구역화영상(001.tif, 002. tif, …, 234. tif)을 Integumentary 폴더의 하위 폴더인 Skin 폴더에 담았다. 각 구조물이 어느 구역화영상에 있는지 표로 간추렸다. 소뇌의 경우에는 0811.tif, 0821.tif, …, 2411.tif 에 있었다.

3. 구역화영상을 합치고 테두리 속에 빛깔을 채움.

여러 구조물의 구역화영상을 한 개의 구역화영상으로 합쳤다. 여러 구조물의 구역화영상들을 합치는 원리는 다음과 같았다. 각 구역화영상의 배경은 검은색이고, 검은색의 RGB 값은 각각 0, 0, 0 이다. 이 논문의 그림에서는 구조물의 테두리를 잘 나타내기 위해 배경을 흰색으로 나타냈다. 구역화영상에 있는 여러 구조물의

255, 뇌줄기는 255, 255, 0 의 RGB 값을 가진다. 구조물의 테두리는 2 화소 굵기의 선으로 그렸기 때문에 서로 겹치지 않는다. 따라서, 각 구역화영상의 RGB 값을 모두 더해주면 검은색을 배경으로 구조물의 테두리들이 모두 더해지게 된다. 이 결과로 모든 구조물의 구역화영상을 합쳐서 243 개의 합친 구역화영상을 만들었다(Fig. 34).

Fig. 34. Segmented images of cerebrum, cerebellum, and brainstem, which are combined (left to right).

합친 구역화영상에서 구조물의 테두리 속에 테두리와 같은 빛깔을 채웠다.

Photoshop 에서 합친 구역화영상을 열고, ‘eyedropper’ 도구를 써서 한 구조물의 테두리의 빛깔을 선택하였다. ‘magic wand’ 도구를 써서 한 구조물의 테두리 속을 모두 선택한 다음에 ‘paint bucket’ 도구를 써서 한 구조물의 테두리 속을 테두리와 같은 빛깔로 채웠다. 이와 같은 방법으로 합친 구역화영상에 있는 모든 구조물의 테두리 속에 테두리와 같은 빛깔을 채웠다(Fig. 35). 이 결과로 테두리 속에 빛깔을 칠한 합친 구역화영상이 만들어졌으며 이것을 JPEG 파일로 저장하였다.

Fig. 35. Serially-sectioned images (left column) and corresponding segmented images (right column) of head. The second row image shows both anterior commissure (1) and posterior commissure (2).

테두리 속에 빛깔을 칠한 합친 구역화영상으로 이마영상과 마루영상을 만들어서 구역화영상을 확인하였다(Park 등, 2005b). 구역화영상의 이마, 마루영상을 만들기 위해 연속절단면영상의 이마, 마루영상을 만들었던 소프트웨어를 썼다(Fig. 36).

이 결과로 구역화영상의 이마, 마루영상을 만들었다. 이마, 마루영상에서 구조물의 테두리가 매끄러운지 확인하였고, 연속절단면영상에 들어맞는지 확인하였다(Fig. 37).

이마, 마루영상에서 구조물의 테두리가 매끄럽지 않거나, 연속절단면영상에 들어맞지 않는 영상이 있으면 임시구역화영상을 고친 다음에 이마, 마루영상을 새로 만들었다.

Fig. 36. Software to make coronal and sagittal images of segmented images with graphic user interface.

Fig. 37. A couple of sagittal serially-sectioned images and segmented images (top row); a coronal couple (bottom row).