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Molecular Identification and Development of a PCR Assay for the Detection of a Philometrid Nematode in Rockfish Sebastes schlegeli

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Copyright © 2015 The Korean Society of Fisheries and Aquatic Science pISSN:0374-8111, eISSN:2287-8815

서 론

조피볼락

(Sebastes schlegeli)

한국연안을비롯한북서태평 지역에서넓게서식하며

,

넙치와함께국내해산어양식을 표하는어종으로

2014

년에는

24,598

톤을생산되어국내 생산량의

30%

차지하고있다

(KOSIS, 2015). 2012

서해안천수만지역의양식조피볼락에서상피에감염되는 충이최초로확인되었으며

, 2013

년부터

1

년간조피볼락 충의감염현황을조사한결과서해안천수만지역의조피볼락 에서

50%

이상감염되어있는것으로확인되었다

. 2014

조사 결과

,

선충이감염된조피볼락은대부분폐사가발생하지않았 지만

,

여름철고수온기에선충이어체를뚫고나간상처를통하

병원세균의

2

감염이발생함으로써높은폐사가확인되었

.

여름철이후가을철조사에는선충의감염이확인되지않았 으며겨울철조사이후에는다시선충의재감염이확인되었다

(Seo et al., 2014).

Nematode (phylum) Secernentea (class) Camallanida (or- der)

속하는

Philometridae (family)

선충은어류를최종숙주 혹은중간숙주로하여기생을하며

,

현재까지

650

이상이 류에감염되는것으로보고되어있다

.

어류에감염되는

Philo- metridae

선충으로는

Afrophilometra, Alinema, Buckleyella, Caranginema, Clavinema, Dentiphilometra, Margolisianum, Nilonema, Philometra, Philometroides, Philonema, Phlyctai- nophora, Rumai

Spirophilometra

(genus)

보고되어

조피볼락(Sebastes schlegeli) 선충(Nematode: Philometridae)에 대한 분자생물학적 동정 및 PCR 검출법 개발

서한길·서정수·류민경·이은혜·정승희·한현자*

국립수산과학원 병리연구과

Molecular Identification and Development of a PCR Assay for the Detection of a Philometrid Nematode in Rockfish Sebastes schlegeli

Han-Gill Seo, Jung Soo Seo, Min Kyung Ryu, Eun Hye Lee, Sung Hee Jung and Hyun-Ja Han*

Pathology Research Division, National Fisheries Research and Development Institute, Busan 46083, Korea

Nematode infection in the epithelial tissue of cultured rockfish Sebastes schlegeli was first reported in 2012. Since then, nematode infections have caused serious economic losses in rockfish aquaculture on the west coast of Korea.

Taxonomic and life cycle information for this parasite are currently unknown. In this study, 18S rRNA and cyto- chrome c oxidase subunit I (COI) genes were used for molecular identification and polymerase chain reaction (PCR) to detect the invisible stages of this parasite. Nucleotide sequences of the 18S rRNA of the rockfish nematode showed 98% identity with that of Philometra morii . Therefore, this rockfish nematode was classified to the Philometridae family. However, we could not identify it to genus level using 18S rRNA. Its COI nucleotide sequences shared 85%

and 82% identities with those of Bursaphelenchus sinensis and Philometra overstreeti , respectively. In addition, two gene-specific primer sets were designed based on the 18S rRNA gene to detect the intermediate host and nematode larvae. These primers were specific to this rockfish nematode without cross-reacting to other pathogens. The detec- tion limit of the PCR assay using these primers was 1,000 copies of nematoda plasmid DNA. Therefore, the PCR assay described here is suitable for the detection of nematode DNA within rockfish. In addition, this PCR assay could be used to detect nematode larvae and the intermediate host.

Key words: Philometrid nematode, Rockfish, 18S rRNA gene, Cytochrome c oxidase subunit I gene, PCR

This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Non-Commercial Licens (http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/) which permits unrestricted non-commercial use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.

http://dx.doi.org/10.5657/KFAS.2015.0731

Korean J Fish Aquat Sci 48(5) 731-738, October 2015

Received 17 August 2015; Revised 25 September 2015; Accepted 7 October 2015

*Corresponding author: Tel: +82. 51. 720. 2483 Fax: +82. 51. 720. 2498

E-mail address: [email protected]

(2)

있다

(Moravec and Harrison, 1989; Moravec and Wang, 2002;

Wijová et al., 2006).

선충은가늘고원통형또는모양 형태를하고있으며종숙주인어류의근육

,

비늘

,

생식

,

부레등에기생하지만소화관에기생하는것이가장많다

.

선충은암수가따로존재하는자웅이체로서교미를통하여 식하며대부분은난생으로서수중에서난이부화하여자충이 방출되지만

, Philometridae

선충의경우태생으로서암컷이 충을수중으로방출한다

.

선충은생활사에서중간숙주를필요 하며

,

자충은갑각류와같은중간숙주에먹힌어류와 종숙주가최종적으로먹어어류내에서성충으로성장한다

(Edward, 1996). Seo et al. (2014)

보고한조피볼락선충은 성충의경우상피층에위치하여육안으로쉽게확인이가능하 지만자충의경우육안으로확인이불가능하여진단에어려움 따른다

.

따라서조직내에위치한선충의자충을확인하기 해서는외부관찰이외의다른진단법이필요하다고생각하였

. Stephanie et al. (2011)

South Carolina

퇴적지에서찾아

philometrids

생활사를밝혀내기위하여어류의장에기생 하는선충의자충을현미경으로확인한

Polymerase Chain Reaction (PCR)

법을통하여양성체를찾아내었다

. Kang et al.

(2008)

고래회충유충의검출을위하여육안적검사와더불

Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polmorphism (PCR-RFLP)

법을 통하여 양성체를 찾아내었

.

연구에서도마찬가지로조피볼락선충의생활사를밝히 위하여선충자충의탐색이필요하다고생각되었으며

,

자충 포함된중간숙주역시육안적인방법이외의다른검출법이 필요하다고생각되었다

.

특정유전물질을대량으로증폭하는

PCR

법은최근어류의질병진단에많이사용되고있는방법으 로서샘플의처리

,

병원체에대한특이성재현성이높아각광 받고있는진단법이다

.

분자생물학적분류동정을위한유전자마커로는

ribo- somal RNA (rRNA), mitochondrial DNA (mtDNA)

mic- rosatellite DNA

등이일반적으로사용된다

.

진핵생물의단백질 합성에있어중추역할을하는

ribosomal DNA

유전자의 통발생학적분석에사용되는

rRNA

code

하는분자마커로

18S, 5.8S

28S

유전자와

internal

external transcribed spacers (ITS and ETS)

구성되어있다

.

이중

18S rRNA

전자의변이가심하지않기에다양한생물군의분류에사용되 있다

(Nyaku et al., 2013). mtDNA

고변이성유전자로서 종의진화적유연관계를나타내고있으며

,

cytochrome c oxidase subunit I (COI)

다양한해양무척추동물들의유전 학적연구에사용되는유전자마커이다

(Edmands et al., 1996).

Cytochrome

생체세포내에존재하는헴단백질색소하나 로서고등동식물의세포

,

세균

,

곰팡이효모등의미토콘드리 아에존재한다

. Cytochrome

포르피린의구조

,

단백질과 결합상태에따라

a, b, c

d

4

군으로구별되는데

,

중에

cytochrome c

산화환원반응에관여하는효소로서미토콘

드리아의외막에존재하며호흡과순환에의해세포내에운반 산소를활성화하여세포호흡을원활하게하는필요하다

. Cytochrome c oxidase

cytochrome c

에서전자를직접분자 산소로넘겨주는효소활성을하는호흡효소를뜻하는데 물군은미토콘드리아의

COI

표준바코드유전자로이용하여 동정에사용하기도한다

. Herbert (2003)

DNA barcoding

기법이유전자서열을이용하여종을동정하는방법으로서 당하며동물의동정으로미토콘드리아의

COI

유전자서열을 사용할것을제안하기도하였으며

,

최근의다른연구에서는 토콘드리아

COI

유전자염기서열의다형성을바탕으로어류간 계통유연관계를확인하기도하였다

(Han et al., 2014).

따라서연구에서는선충의

18S rRNA

COI

유전자를

폭시킬있는

primer

사용하여선충유전자분석을실시하

였으며

,

획득한염기서열을바탕으로조피볼락에서분리된 충의계통발생학적분석을실시하였다

.

또한어류조직내에 치한선충자충의분석중간숙주의탐색에사용하기위하여

18S rRNA

유전자를증폭시킬있는

primer

제작하고

,

충을분자생물학적으로검출할있는

PCR

법을개발하였다

.

재료 및 방법

선충 시료 채취 및 DNA 추출

2014

년도

1

,

서해안천수만일대에양식중인조피볼락에서 선충을분리

100% ET-OH

고정하여보관한시료를

DNA

추출을위해사용하였다

. 50 mg

선충을

E-tube

넣고

PBS

사용하여마쇄하였고

,

원심분리

(8,000 rpm, 10 min)

상청 액을회수하였다

. DNA

추출은

High pure template preparation kit(Roche, Germany)

사용하였으며

,

제조사의매뉴얼에 수행하였다

.

분자생물학적 동정

선충의동정을위하여

18S rRNA

COI

유전자를분석 하였다

. PCR

법은

Emerald Taq (Takara, Japan)

사용하여 제조사의 매뉴얼에 따라 수행하였으며

,

primer sequence

PCR

조건은

Table 1

표기하였다

. PCR product

1.5%

agarose gel (Bioneer, Korea)

상에서 전기영동을 실시하여

band

확인하였으며

, PCR

증폭이확인된시료는

sequenc-

ing

실시하여 염기서열을 확인하였다

.

염기서열의 분석에

BioEdit Ver. 7.2.3, MEGA Ver. 6

사용하였으며

, National

Center for Biotechnology Information (NCBI)

에서제공되는

Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)

이용하여 존에보고된선충유전자와의상동성분석을하였다

.

또한 어진염기서열을바탕으로실시한유전자계통분석은

BioEdit

Ver. 7.2.3 program

사용한염기서열정렬과

MEGA Ver. 6

program

사용한근린결합분석

(NJ; neighbor-joining analy-

sis, 1000 rounds of bootstrap)

통하여염기서열간의

(3)

전적거리와계통도

(phylogenetic tree)

획득하였다

.

연구 에서비교한

18S rRNA (1,695 bp)

염기서열은

GenBank

록되어있는

Philometridae

속하는

8

종의선충

18S rRNA

전자

(Philometra morii, Philometra sp., Philometroides san- guineus, Philometroides seriolae, Clavinema parasiluri, Den- tiphilometra monopteri, Nilonema senticosum, Rumai rumai, Philonema oncorhynchi)

Anisakidae

속하는

4

종의

18S rRNA

유전자

(Anisakis sp., A. pegreffi, A. simplex)

염기서 열을대상으로분석하였다

(Fig. 2A).

또한

COI (389 bp)

염기 서열은

Philometra overstreeti, Philometroides paralichthydis, A. pegreffii, A. simplex

유전자염기서열을대상으로분석 하였다

(Fig. 2B).

조피볼락 선충 검출 PCR법 개발

연구에서얻어진조피볼락선충의

18S rRNA

염기서열

다른

Philometridae

18S rRNA

염기서열의차이가보이 특이적인영역에서

2

개의

primer set

제작하여선충검출 위한

PCR

개발에사용하였다

. PCR

조건은

Table 1

기하였으며

, PCR annealing

온도에따른검출률도확인하였

.

또한조피볼락의선충검출에사용된

primer

특이성을 증하기위하여선충을포함한다른기생충세균의

DNA

추출한

PCR

실시하였다

.

실험에사용된기생충은 조피 볼락에서분리된선충이외에어류에서분리된스쿠티카

,

쿠도 아니사키스충을사용하였으며

,

세균은어류에서분리된

Edwardsiella tarda

Streptococcus iniae

사용하였다

.

넙치에서유래된스쿠티카충은보유중인

CHSE-214

어류주 화세포에서배양중인신선한충을사용하였으며쿠도아충은 치의근육에서분리된것을사용하였다

.

아니사키스충은조피

볼락과넙치의내장에서각각분리된

100% ET-OH

고정

것을사용하였으며

,

각각의기생충은상법과동일하게

DNA

추출한

PCR

사용하였다

.

또한세균은

1.5% NaCl

포함된

Brain Heart Infusion (BHI, Gibco, USA) broth

배지에

25℃

에서

12

시간동안배양된신선한균을사용하여상법과 동일하게

DNA

추출한

PCR

사용하였다

. PCR product

1.5% agarose gel (Bioneer, Korea)

상에서전기영동을실시 하여

band

확인하였다

.

선충검출

PCR primer

감도확인실험은 다음과같은

법으로실시하였다

.

조피볼락에서분리된선충의

PCR prod- uct

1.5% agarose gel

상에서전기영동을실시한

, PCR product purification kit (Roche, Germany)

사용하여

Gel Purification

실시하였다

.

정제된

PCR product

pGEM T- Easy vector (Promega, USA)

사용하여

cloning

실시하 였고

, Plasmid Mini Extraction kit (Bioneer, Korea)

사용하

plasmid DNA

획득하였다

.

선충의

plasmid

copy

수를 계산한

Nuclease-free water (Bioneer, Korea)

사용하여

1×10

10

copy

부터

1×10

0

copy

까지

10

배씩단계희석하였고

template

하여

PCR

실시하였다

. PCR product

1.5%

agarose gel

상에서전기영동을실시하여

band

확인하였다

.

결과 및 고찰

연구에서는조피볼락에서분리된선충의분자생물학적 정을실시하기위하여선충류의

18S rRNA

COI

유전자를 증폭할있는

universal primer

각각사용하여

PCR

전자분석을실시하였다

. 18S rRNA

유전자를증폭하기 하여

Quiazon (2009)

논문에인용된

PCR

조건을사용하였

으나

, PCR

반응이일어나지않아

PCR

조건을수정하여설정

하였다

(Table 1).

조피볼락선충의

genomic DNA

template

사용하여

18S rRNA

유전자를증폭한결과

1,695 bp

기서열을 획득하였으며

(GenBank accession no. LC071530),

해당염기서열에대한

NCBI BLAST

결과

Philometra morii 18S rRNA gene (JF803933)

98%

일치하여상동성이가장 높음을확인하였다

(Fig. 1).

조피볼락선충의

18S rRNA

유전 Table 1. Primer information and PCR condition for this study

Purpose Target

gene Primer Nucleotide sequence (5’ to3’)

PCRCondition (annealing temp.oC, / PCR cycles)

PCRsize (bp) References

Molecular identification

18S rRNA nema35f TATAATGGTGAAACCGCGAACGGC

61/ 30 1,694 Qiazon (2009) nema18gM GGAAACCTTGTTACGACTTTTGCC

Cytochrome

oxidase subunit I NemCOI 5P CATTTRTTTTGRTTTTTTGG

55/ 45 424 Stephanie et al.

(2011) NemCOI 3P ACYACATRATAAGTATCRTG

Specific

detection 18S rRNA

RN-18S 1F TAGTCGGCGAATAATGAACCTT

55/ 30

183 This study RN-18S 1R GTTACCTTTGCCTTTCGACAAC

RN-18S 2F GCAATTATTTCCCTTGAACGAG

206 This study RN-18S 2R AAGGCGGTTTCTACCCTCTATC

(4)

계통발생학적분석결과어류에기생하는

nematode

중에서

Philometridae

(family)

속하는선충으로확인되었으며

, Philometrodae

중에서

Philometra, Philometroides, Clavinema

(genus)

가장근연한것으로확인되었다

(Fig. 2A).

이전

Nyaku et al. (2013)

식물에감염되는선충유전자의계통 발생학적분석을위하여

18S rRNA

사용하였으나

(order)

단계까지만분석이가능하였다

.

연구에서실시한조피볼락 선충의경우에서도

18S rRNA

유전자를통한분석은

(fam- ily)

단계까지만정확한분석이가능하였으며

,

(species)

(genus)

분류를위해서는다른유전자의분석이필요하다고

각하였다

.

하지만조피볼락선충

COI

유전자

(PCR product size 389bp;

GenBank accession no. LC073304)

경우

NCBI BLAST

소나무에서분리되는 선충류인

Bursaphelenchus sinensis

cytochrome c oxidase subunit I (mtCOI) gene (GenBank ac-

cession no. AB232163)

84%

가장높은상동성을보였으

,

넙치에서분리되는선충류인

Philometra overstreeti

COI

유전자

(GenBank accession no. HM035020.1)

와는

82%

Fig. 1. Partial 18S rRNA gene sequences (position 1,173 through 1,695) of philometrid nematode from rockfish Sebastes schlegeli of Korea, indicating position of primer (boxes) used for detection PCR.

(5)

(A)

(B)

Fig. 2. Neighbor-joining analysis of philometrid nematode from rockfish Sebastes schlegeli (A) 18S rRNA and (B) cytochrome c oxidase subunit I sequences from GenBank.

동성이확인되었다

.

현재까지등록된어류를숙주로하는선충 류의

COI

유전정보를바탕으로

phylogentic tree

작성한결과

(Fig. 2B), Philometra, Philometroides

(genus)

가장

연하였으나

,

선충의

COI

유전자의경우타종간유전적차이가 크고

(Stephanie et al., 2011), GenBank

등재되어있는어류 유래의선충의경우

Philometra overstreeti

Philometroides

(6)

paralichthydis

(species)

뿐이어서정확한분류가어려운 으로확인되었다

.

연구결과를통해현재까지

COI

유전자의 경우조피볼락선충분류를위해는유용성이없는것으로확인 되었으며

,

앞으로정확한선충동정을위해서는어류기생성

충류를비롯한다른선충의

COI

유전자정보가추가적으로

구되어야것으로판단된다

.

조피볼락선충을특이적으로검출하기위한

PCR

법을위하여

18S rRNA

염기서열중에서

2

쌍의

primer set

새로디자인하 였다

(Fig. 1).

조피볼락선충검출

Primer

제작을위해서

,

조피

볼락선충의

18S rRNA

상동성이비교적높은다른어종에

분리되는

Philometrodae

기생충의

18S rRNA

유전자염기

서열을비교하여조피볼락선충특이

primer

제작에활용하였

.

선충의

DNA

추출한

PCR

실시한결과

2

종의

primer set

모두에서양성을나타내었으며

, agarose gel

상에서

183

206 bp

band

각각나타내었다

.

추가적으로선충유전자의 검출을위한

PCR

조건의최적화를위하여

BIO-RAD

회사의

Peltier Thermal Cycler (PTC-0220)

사용하여

gradient PCR

실시하였다

.

조절된

annealing temp

42-62℃

이었으며

2

종의

primer

모두

55℃

에서최적의조건을나타내었다

(data not shown).

조피볼락 선충특이적

primer

검증을위하여

5

종의 기생

(

조피볼락유래선충아니사키스충

,

넙치유래스쿠티카

,

아니사키스충 쿠도아충

)

2

종의 세균

(Edwardsiella tarda, Streptococcus iniae)

사용한

PCR

결과조피볼락선충

DNA

제외한모든시료에서는증폭이확인되지않았다

(Fig.

3A, B).

위의결과로연구에서제작된

RN-18S 1

2

primer sets

조피볼락상피선충의유전자를특이적으로

폭시킬있는것으로확인되었다

.

다른시기에다른양식장 에서분리된선충들간의유전자분석결과차이점이확인되지 않았으나

(data not shown),

추가적으로어종에서분리되는

Philometrid nematodes

확보하여검증할필요가있을것으 사료된다

.

조피볼락선충검출용

primer

사용하여선충유전자가증폭

plasmid DNA

제작하였고

,

검출감도를확인하였다

.

18S rRNA plasmid DNA

1×10

10

copy

부터

1×10

3

copy

까지

band

확인되었으며

primer

에서비슷한검출감도를 확인할있었다

(Fig. 4A, 4B).

Philometrid nematodes

생활사에서자충은중간숙주에 먹히게되고

,

중간숙주를어류가먹어서종숙주에감염이

.

중간숙주는대개요각류

(copepodes)

로서유영생활을하며 어류의먹이가된다

(Wang, 2002).

체내에새끼를가지고있는 암컷선충의경우숙주의근육을통해피부를관통하여구멍을 생성한다

.

상처를통하여자충을수계로배출하며

,

자충 중간숙주가섭취하며최종적으로어류에감염이된다고

(Gonzalez et al., 2007). Seo et al. (2014)

2013

8

,

피볼락의피부에서선충이감염된어체외부로빠져나가면

생긴다수의상처를발견하였다

.

또한

2013

10

,

선충의 감염이확인되지않았기에선충은

1

주기의생활사를가지

,

고수온기어체의피부에상처를내어자충을방출한다고 각된다

.

선행연구와마찬가지로성충의경우에육안으로검사 가능한선충은자충의경우육안으로확인이불가능하며 중간숙주도마찬가지이다

. Seo et al. (2014)

의하면선충 류의특성상숙주로부터선충을감염이후에치료는매우어려 우므로

,

생활사선충의감염을차단하여야하며

,

선충의중간 숙주를탐색하여감염경로를제거하는방법에대한연구가 Fig. 3. PCR results obtained using (A) RN-18S1 primer and (B) RN-18S2 primer sets, with lanes M to 7 as follows: 100 bp DNA ladder, Nematode with rockfish Sebastes schlegeli, Scutica with flounder Paralichthys olivaceus, Kudoa with flounder, Anisakis with rockfish, Anisakis with flounder, Edwardsiella tarda and Streptococcus iniae.

(7)

요하다고하였다

.

따라서연구에서개발한선충의유전자 출을위한

PCR

법을사용한다면어류또는생사료등에존재 가능한자충을포함한중간숙주의탐색이가능하며생활사의 규명에도움이것이라생각한다

.

연구에서는양식조피볼락에서분리된선충의

18S rRNA

유전자분석결과

Philometridae

Philometra

가장유전적 유연관계가높지만

,

정확한동정은하지못하였기에

,

현재 형태학적분석을통한동정을수행하고있다

.

하지만

,

연구 에서는조피볼락선충유전자를검출할있는새로운

PCR

개발하였으며

,

이는향후어류조직내에위치한선충자충 검출중간숙주의탐색등에유용하게사용될있을 이라생각한다

.

사 사

논문은

2015

년도 국립수산과학원 수산과학연구사업

(R2015067)

지원으로수행된연구이며연구비지원에감사

드립니다

.

References

Edmands S, Moberg PE and Burton RS. 1996. Allozyme and mitochondrial DNA evidence of population subdivision in the purple sea urchin Strongylocentrotus purpuratus. Mar

Biol 126, 443-450.

Edward JN. 1996. Diagnosis and Treatment, Fish Disease.

Blackwell, Iowa State University Press, Iowa, U.S.A., 166- González-Solís D, Moravec F and Paredes VM. 2007. A new 170.

species of Dentiphilometra (Nematoda: Philometridae) from the musculature of the gray snapper Lutjanus griseus (osteichthyes) off the Caribbean coast of Mexico. J Parasitol 93, 1132-1135. http://dx.doi.org/10.1645/GE-1238R.1.

Han SH, Lee YD, Baek HJ, Oh HS and Noh CH. 2014. Genetic structure and phylogenetic relationship of red spotted grou- per (Epinephelus akaara) based on the haplotypes and poly- morphisms of mitochondrial COI gene sequences. J Life Sci 24, 626-632. http://dx.doi.org/10.5352/JLS.2014.24.6.626.

Herbert PDN, Cywinska A, Ball SL and deWaard JR. 2003. Bio- logical identifications through DNA barcodes. Proc Biol Sci 270, 313-321. http://dx.doi.org/10.1098/rspb.2002.2218 Kang JH, Lee MH, Lee KB and Choi CS. 2008. Comparison

of macroscopic inspection and polymerase chain reaction- restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) for the detection of Anisakis simplex complex. J Fd Hyg Safety 23, 314-318.

KOSIS. Korean Statistical Information Service. Retrived from http://kosis.kr/statHtml/statHtml.do?orgId=101&t blId=DT_1EZ0008&vw_cd=MT_ZTITLE&list_

id=F38&seqNo=&lang_mode=ko&language=kor&obj_

var_id=&itm_id=&conn_path=E1# on July 2015.

Moravec F and Harrison FS. 1989. Paraphilometroides nemip-

teri gen. et sp. N. (nematoda:philometridae) from the marine

fish nemipterus peronei (valenciennes) from Malaysia. Folia Parasitol 36, 345-350.

Moravec F and Wang GT. 2002. Dentiphilometra monopteri n.

gen., n. sp. (nematoda: philometridae) from the abdominal cavity of the ricefield eel monopterus albus in china. J Para- sitol 88, 961-966. http://dx.doi.org/10.2307/3285538.

Nyaku ST, Sripathi VR, Kantety RV, Gu YQ, Lawrence K and Sharma GC. 2013. Characterization of the two intra-indi- vidual sequence variants in the 18S rRNA gene in the plant parasitic nematode, Rotylenchulus reniformis. PLoS ONE 8,e60891. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0060891.

Quiazon KMA. 2009. Studies on philometrid and anisakid nematodes infecting marine fishes in Japanese waters. Ph.D.

Thesis, The University of Tokyo, Tokyo, Japan.

Seo HG, Seo JS, Ryu MK, Lee EH, Kwon SR, Kang JS, No YS, Choi HS, Jung SH and Han HJ. 2014. A nematoda infection in the Epithelial Tissue of Cultured Rockfish Se-

bastes schlegeli in Cheonsu Bay, Western Korea. Korean

J Fish Aquat Sci 47, 603-610. http://dx.doi.org/10.5657/

KFAS.2014.0603

Stephanie P, Weatherly AM, Isaure DB, William AR and Al- lan ES. 2011. Use of molecular tools in identification of philometrid larvae in fishes: technical limitations parallel Fig. 4. Analytical sensitivity of PCR for detection of philometrid

nematode from rockfish Sebastes schlegeli. Plasmid DNA com- posing 18S rRNA gene of philometrid nematode was serially di- luted from 1010 to 100 was used for PCR. Lanes 1 to 11: DNA ladder, 1010, 109, 108, 107, 106, 105, 104, 103, 102, 101 and 100 copy of plasmid DNA/tube. A, RN-18S1; B, RN-18S2.

(8)

our poor assessment of their biodiversity. Parasitol Res 109, 1725-1730. http://dgx.doi.org/10.1007/s00436-011-2481-6 Wang GT. 2002. Seasonal dynamics and distribution of Philome-

troides fulvidraconi (Philometridae) in the bullhead catfish, Pseudobagrus fulvidraco (Richardson). J Fish Dis 25, 621-

625. http://dx.doi.org/10.1046/j.1365-2761.2002.00416.x Wijová M, Moravec F, Horák A and Lukeś J. 2006. Evolutionary

relationships of Spirurina (Nematoda: Chromadorea: Rhab- ditida) with special emphasis on dracunculoid nematodes inferred from SSU rRNA gene sequences. Int J Parasitol 36, 1067-1075. http://dx.doi.org/10.1016/j.ijpara.2006.04.005.

수치

Fig. 2. Neighbor-joining analysis of philometrid nematode from rockfish Sebastes schlegeli (A) 18S rRNA and (B) cytochrome c oxidase  subunit I sequences from GenBank.

참조

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