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Characterization of Prunus necrotic ringspot virus Isolate from Peach in Korea

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Res. Plant Dis. 15(3) : 170-174 (2009)

©The Korean Society of Plant Pathology

국내 복숭아에서 분리한 Prunus necrotic ringspot virus의 특성

김현란*·이신호1·신일섭·김정희·조강희·허 성·김정수2·최용문3 농촌진흥청 국립원예특작과학원 과수과

,

1한국과수농협연합회

,

2농촌진흥청 국립농업과학원

,

3농촌진흥청

Characterization of Prunus necrotic ringspot virus Isolate from Peach in Korea

Hyun Ran Kim

*

, Sin-Ho Lee

1

, Il-Sheob Shin, Jeong Hee Kim, Kang-Hee Cho, Seong Heo, Jeong Soo Kim

2

and Yong Mun Choi

3

Fruit Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, Rural Development Administration, Suwon 441-440, Korea

1

Korea Fruit Agricultural Co. Federation, Seoul 137-133, Korea

2

National Academy of Agricultural Science, R.D.A. Suwon 441-707, Korea

3

Rural Development Administration, Suwon 150, Korea (Received on July 23, 2009; Accepted on October 28, 2009)

In this paper, we report a characterization of Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV) isolate. The virus was identified from ‘Yumyeong’ peach showing mild mosaic on leaves in commercial orchard of ‘Umsung’, Chungbuk province in Korea. The virus isolate produced ringspot symptom on the inoculated cotyledons and systemic mosaic and malformation on the upper leaves of Cucumis sativus . Systemic mottles were appeared in Chenopodium quinoa . When the buds of the virus infected stem were grafted on the healthy young Prunus persica GF305 seedlings, line pattern with mosaic appeared within 3 months. Isometric virus-like particles were found in parenchyma cells and plasmodesmata of C. sativus leaves inoculated mechanically with the virus. The cDNA fragments of PNRSV coat protein (CP) region, approximately 675bp, were synthesized from genomic RNA extracted from virus-infected leaves by RT-PCR using specific primer pairs. Partial nucleotide sequences of the CP regions were determined and analyzed with the known PNRSV. The CP gene of PNRSV- Korea isolates showed 93.9~94.7% similarity to the 4 known PNRSV isolates.

Keywords : Ilarvirus, Indicator assay, RT-PCR detection, Peach, PNRSV

복숭아

,

살구

,

자두 핵과류에는 세계적으로 심각

문제를 일으키는

Plum pox virus (PPV)

포함하여

18

여종의 바이러스와

3

종의바이로이드가 보고되어있다

.

국내에서는 복숭아나무에서의

Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV)

발생이

(2001)

의해발표된 보고가

있을 복숭아 바이러스병에관한논문은 거의없는 정이다

.

한편

, PNRSV

세계적으로 복숭아

,

양앵두

과류에서 경제적인 피해를 주는 주요 바이러스 중의 나로 보고되어 있으며

(Smith

, 1972; Wood

, 1979)

분류학적으로는

Family Bromoviridae , Genus Ilarvirus subgroup 3

속하는 바이러스이다

(Alan

, 1995).

바이

러스 입자는 직경

23 nm

정도의 크기로 구형과 간상형

입자로존재한다

.

접목

,

화분에 의해전염되고 종자로

전염이가능한 것으로 알려져 있으며 초본식물에서는 즙액접종으로감염되는것으로보고되어있다

(Fulton, 1970;

1983).

현재까지국내에서

Ilarvirus

관한연구는

Apple mosaic virus (ApMV)

진단기술에 대한 보고가 있지만

(

, 2002;

, 2003)

생물검정을통한바이러스 분리특성

유전자 분석에 관한국내 보고는 없다

.

따라서

,

연구는

Ilarvirus

그룹에속하는 바이러스

우리나라 복숭아 과원에서 검출된

PNRSV isolate

특성을 조사하고자 초본 목본 지표식물을 이용한

*Corresponding author

Phone) +82-31-240-3673, Fax) +82-31-240-3709

Email) [email protected]

(2)

물검정과 세포 바이러스입자 존재양식을 관찰하였으

,

특이프라이머를 디자인하여

RT-PCR

의해증폭된

국내 분리주 외피단백질 유전자 특성을 확인하여 고된분리주와의 유전적 상동성을비교함으로써국내 리주를 동정하였다

.

재료 및 방법

바이러스 생물검정. 충북 음성지역 복숭아 주산단 지의 과수원에 재식되어 있는 ‘유명’ 다양한 품종의

성목을 대상으로스위스

BIOREBA

사의 항혈청을 이용

하여

ELISA

진단법으로 바이러스 감염여부를 스크리닝

하여

PNRSV

감염주를선발하였다

. PNRSV

단독검출주

로부터 잎과가지 부위를 채취하여초본지표식물 지표식물을이용한생물검정에활용하였다

.

초본지표

식물 검정에서는

Ilarvirus

분리기주로 많이 활용되는

C. sativus

포함하여

5

종의지표식물을이용하였으며

자이크증상을 보이는 어린 복숭아 잎을

C. sativus

엽조직에 즙액 접종한 접종엽과 상엽의 병징 발현여 부를관찰하였다

.

목본지표식물검정은핵과류바이러스

대해감수성품종으로보고되어있는

P. persica GF305

품종의 종자를이용하여

Fig. 1

같이 실생묘를 양성한

다음

PNRSV

감염주로부터채취한 녹색가지의 부위

메스로 잘라 접목하였으며 접종

2~3

개월 동안

표식물 잎의 병징 발현여부를 조사하였다

.

병징 발현이

관찰된 잎은

dip

검경과

ELISA

검정을 통해

PNRSV

염여부를 확인하였다

.

전자현미경검경. 인위접종한

C. sativus cv. Beakbong

에서 상엽의 모틀

(mottle)

기형증상을 보이는 잎을

자현미경검경용시료로 이용하였다

.

절편을

1~2 mm

2

크기로 잘라서

karnovsky

고정액으로 고정하고

Spurr's

resin

으로블록을만든다음다이아몬드나이프로자른

박절편을

2% uranyl acetate

lead citrate

이중염색하

방법

(Hayat, 1972)

이용하였으며

Carl Zeiss LEO 906 TEM

으로 세포 바이러스 입자를 관찰하였다

.

RT-PCR 및염기서열분석. 병징을나타내는

C. sativus

상엽을 절취하여

Qiagen RNeasy Plant kit

이용

, total

RNA

추출하여

PCR

진단에 사용하였다

. GenBank

database

공개되어 있는 염기서열정보와

RT-PCR

기술

(Spiegel

, 1996, Hammond

, 1998)

참고하여

PNRSV

외피단백질 유전자부분을 기준으로 특이프라이

머를

Table 1

같이 디자인하여

RT-PCR

이용하였다

. RT-PCR

증폭조건은

45

o

C 45

(1cycle)

94

o

C 2

(1 cycle)

처리

94

o

C 30

초→

60

o

C 1

분→

68

o

C 2

분간

40 cycle

리하였으며 최종적으로

68

o

C

에서

7

1 cycle

처리한

1% Agarose gel

상에서 전기영동하여

ethidium bromide

Fig. 1. Bioassay protocols using P. persica ‘GF305’ woody indicator.

Table 1. Oligonucleotide primers used to amplify the PNRSV coat protein gene

Primers Sequences Product size (bp) PNRSV-P1 ATG GTT TGC CGA ATT TGC AA

PNRSV-P2 CTA GAT CTC AAG CAG GTC TT 675

(3)

염색하여특이밴드를확인하였다

.

증폭된 유전자의

기서열 분석은

ABI Prism 377 Genetic Analyzer

이용

,

Bioneer

사에 의뢰하여 결과를 획득하였으며분석된 염기

서열 결과는

DNASTR

프로그램을 이용하여

Genbank

보고된 분리주와의 상동성을 비교하였다

.

결과 및 고찰

충북 음성 복숭아 주요 재배과원의 성목을 대상으

ELISA

법으로

PNRSV

감염여부를 스크리닝 결과

음성지역 농가의 ‘유명’ 품종의 약한 모자이크증상의

에서

PNRSV

양성반응이 확인되었다

.

모자이크 증상을

나타내는 잎을

Table 1

에서와 같이

Chnopodium quinoa

5

종의초본지표식물에 접종하여반응을조사한 결과

, C. quinoa

C. amaranticolor

상엽에

mottle

병징이

관찰되었으며

C. sativus

접종자엽에

ringspot

엽에

mosaic

병징이 나타나다가 잎이기형화되고선단부

생육이 불량해지면서 고사되는 것을 관찰할 있었

(Table 2).

이러한 지표식물의반응은

Salem

(2004)

보고한 결과와 일치하였다

.

P. persica GF305

품종을 이용한목본지표식물 검정에

서는 접종

3

개월후부터 신엽에

vein banding

증상이

찰되었다

(Fig. 2). C. sativus

접종엽에 나타난 국부

반을 채취하여 접종한 다음

2

병징이 발현된 잎의

혈청학적 반응을 조사하기 위해 잎을 절취하여

PNRSV,

Prune dwarf virus (PDV)

Cherry leafroll virus (CLRV)

핵과류에 감염 가능한 구형 바이러스

3

(Alan

,

1995)

항혈청에 대해

ELISA

진단한 결과

, C. sativus

P. persica GF305

품종모두

PDV

CLRV

항혈청에 대해

서는반응이 나타나지않은 반면

PNRSV

대해서만

성반응을 보여

PNRSV

감염에 의한 병징인 것으로 확인

있었다

.

보고된생물검정에서도

C. sativus

에서자엽에

yellow chlorotic local lesion

나타나고

point stunt

나타난다

보고되어 있으며

, C. quinoa

에서

systemic mottle

증상

나타나는 것으로 보고되어 있어

(Fulton, 1970, 1983),

연구에서 얻은결과와 유사하였다

.

보통

PNRSV

증식 기주로서

C. sativus

사용하는 것으로 보고되

있으며

(ICTV DB 00.010.0.02.015)

연구에서도

험용 바이러스원을

C. sativus

접종주를 활용하였다

. C. sativus

이병세포에 대한

TEM

검경에서 엽육조직

세포내에 구형의 바이러스입자가 존재하는 것을관찰할

있었으며

Plasmodesmata

바이러스 입자가 존재하

Table 2. Reaction of indicator plants inoculated with PNRSV-Ko Indicator plants Response on leaves

Inoculated Upper Chenopodium quinoa Moa Mo Chenopodium amranticolor NS NS Nicotiana glutinosa NS NS Nicotiana tabacum cv. Xanthi NS NS Cucumis sativus RS M, Mf, TN

a

M; mosaic, Mf; malformation, Mo; mottle, NS; no symptoms, RS;

ringspot, TN; Top necrosis.

Fig. 2. Symptoms of PNRSV on peach and indicator plants. (A) mild mosaic on peach, (B) ringspots on C. sativus cotyledons, (C) mosaic and malformation on C. sativus, (D) mosaic with line pattern on P. persica GF305.

Fig. 3. Electron micrographs of C. sativus leaves inoculated mechanically with PNRSV-Ko. Arrows indicate virus particles.

(4)

형태도 확인할 있었다

(Fig. 3).

이는바이러스 입자

형태가 구형인 바이러스 종인

Nepovirus , Comovirus , Fabavirus , Ilarvirus

등이 공통적으로 가지는 세포병리학 특성으로 보고되어 있다

(Martelli, 1980).

PNRSV

외피단백질유전자를 특이적으로 증폭하도록

디자인한

Table 1

프라이머를이용하여

C. sativus

접종

엽을

RT-PCR

결과

675bp

크기의특이적인 증폭산

물을 얻을 있었다

(Fig. 4).

증폭된 특이산물을 회수하여 염기서열 분석을 수행하

NCBI

공개된 외국의 기보고 분리주

4

개와 유전적

상동성을 비교한결과

93.9~94.7%

상동성을나타내

것으로확인되었고

(

자료생략

),

이에대한

phylogenetic tree

작성하였다

(Fig. 5).

논문은

PNRSV

대한국내 보고로서 생물검정

결과와

RT-PCR

진단 기술은금후전국적인 발생모니터

링과 피해구명에 관한 연구의 기반기술로 활용될 것으로 판단된다

.

요 약

국내의 복숭아 과수원 중에 충북 음성지역의 유명 종에서 약한 모자이크증상 잎으로부터

Prunus necrotic

ringspot virus (PNRSV)

분리 동정하였다

.

지표식물을

이용한 생물검정에서

Cucumis sativus

접종 자엽에 형모양의 반점이 관찰되었으며 상엽으로 전이되어 모자 이크와 잎기형 증상을 나타내다가고사하는 것으로 나타 났다

.

접종한

Chenopodium quinoa

접종엽과상엽에도 틀증상을나타내었다

.

목본지표식물

Prunus persica GF305

활용한 검정에서는 바이러스 감염된 줄기의 눈을 위적으로 접종한

3

개월 후에 잎에 라인 패턴의 모자

이크 증상을 관찰할 있었다

.

인위접종한

Cucumis sativus

잎조직의 세포 검경에서

parenchyma cells

plasmodesmata

내에존재하는구형

이러스 입자가 관찰되었다

.

PNRSV

외피단백질 유전자 분석을 위해

RT-PCR

프라이머와조건을 설정하고분석한 결과

675bp

위치

에서특이적으로증폭된것을확인할 있었다

.

또한

폭산물을 회수하여염기서열 분석한 결과보고된

4

PNRSV isolate

93.9~94.7%

유전적상동성을보였다

.

결론적으로복숭아과수원에서분리한바이러스주의 물적 특성과 유전자분석결과를 종합하여

Ilarvirus

하는

PNRSV

것으로 최종동정하였다

.

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Fig. 4. Agarose gel electrophoretic analysis of cDNA products from RT-PCR of PNRSV-infected C. sativus leaves using PNRSV-CP gene-specific primers.

Fig. 5. Phylogenic tree analysis of the CP gene nucleotide sequences of PNRSV-Ko isolate. PNRSV-ku, Genbank accession No. AY037791; PNRSV-gg, AY037788 ; PNRSV-nt, AY037790 ; PNRSV-yug, AY037789 ; PNRSV-Ko.

(5)

protein genes of two isolates of Apple mosaic virus from Fuji apple.

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Wood, G. A. 1979. Virus and virus-like diseases of pome fruits and stone fruits in New Zealand. DSIR Bull. Wellington 226:

87.

수치

Fig. 1. Bioassay protocols using P. persica ‘GF305’ woody indicator.
Fig.  3.  Electron  micrographs  of  C.  sativus  leaves  inoculated mechanically with PNRSV-Ko
Fig. 4.  Agarose gel electrophoretic analysis of cDNA products from  RT-PCR  of  PNRSV-infected  C

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