한우에서 ANK1 유전자 Promoter 지역 내 단일염기변이(SNP)와 경제형질간 연관성 분석

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한우에서 ANK1 유전자 Promoter 지역 내 단일염기변이(SNP)와 경제형질간 연관성 분석

방찬미^1,2 · 공홍식^1*

국립한경대학교 유전정보연구소¹, 국립한경대학교 대학원 동물생명환경과학과²

SNPs in Promoter Region of Hanwoo ANK1 Gene with Their Effects on Economic Traits in Hanwoo

Chanmi Bang^1,2 and Hong-sik Kong^1*

1Genomic Informatics Center, Hankyong National University, Anseong 17579, Korea,

2Department of Animal Life and Environment Science, Graduate School, Hankyong National University, Anseong 17579, Korea

ABSTRACT¹⁾

The ANK1 (Ankyrin-1) gene, located on the bovine chromosome 27, encodes a structural protein which forms an important component of the cytoskeleton. Ankyrin belongs to a protein family that links membrane proteins to the underlying spectrin-actin cytoskeleton. Many studies on gene expression regulation have revealed that RNA polymerase binds to the ANK1 gene promoter region. The purpose of the present study was to investigate the relationship between the SNP of the ANK1 promoter region and economic traits in Hanwoo cattle. A total of seven SNPs (C-944T, C-733T, C-687G, A-672G, C-307T, A-104G, C-24T), found in 119 animals, were correlated to economic traits. One of these SNPs, A-104G, was reported for the first time in the present study. Three newly discovered haplotypes were not associated with economic traits. Significant (p<0.05) relationships were found between C-944T and carcass weight, backfat thickeness, loin muscle area and between C-733T, A-672G and intramuscular fat. These results suggest that the SNPs of ANK1 gene may be useful molecular markers for selection of meat yield and quality traits in Hanwoo

(Key words: ANK1, Promoter, Hanwoo, Economic Trait)

Ⅰ. 서론

한우는 다른 소에 비해 콜레스테롤 함량이 낮고 올레인 산과 같은 불포화지방산 함량이 높아 고급육으로 판매되고 있다(Choi 등, 2008). 그러나 2001년 수입 쇠고기 시장을 개 방하여 FTA를 통해 호주와 캐나다 등 쇠고기가 수입되면 서 한우는 값싼 수입 쇠고기와 소비시장에서 경쟁에 놓여

있는 실정이다. 이러한 현실을 극복하기 위해 많은 연구자 들은 한우를 수입 쇠고기와 차별화시키기 위해 여러 측면 에서 해결 방안을 모색하고 있으며, 또한 국내 소비자들의 쇠고기 선호도를 고려하여 투자대비 높은 효율을 얻기 위 해 한우 개량에 힘쓰고 있다. 이러한 많은 노력의 일각에서 는 분자유전학적 기법을 통해 한우의 육량형질(도체중, 등 지방두께)과 육질형질(근내지방도, 육색)에 대한 유의적인

* Corresponding Author: Hong Sik Kong, Genomic Informatics Center, Hankyong National University, Anseong 17579, Korea. Tel:

+82-31-670-5334, E-mail: [email protected]

This is an Open Access journal distributed under the teams of the Creative Commons Attribution Non-Commercial License (http://creativecommons.org/licenses(by-nc/3.0) which permits unrestricted non-commercial use, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.

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유전자를 발굴하고 유전적 경향을 연구하여 한우 육종 및 개량의 방향에 대한 연구가 활발히 진행되고 있다.

최근 ANK1(Ankyrin-1) 유전자는 meat quality 후보 유전 자로 연구되고 있다. Ankyrin 단백질은 spectrin-actin으로 구성된 cytoskeleton의 기본 구성요소를 형성하는 구조 단 백질로 알려져 있으며, 근육의 근원섬유 및 근육망 사이에 복잡한 근육섬유를 서로 연결하는 구조로 형성되어 있다 고 보고되었다(Rubtsov와 Lopina, 2000). Van Deveire 등 (2012)의 보고에 따르면, human muscle에서 ankyrin repeat domain 6를 코딩하는 ANKRD6 유전자 내에 synonymous SNPs는 근육 크기와 연관이 있다고 하였으 며, 돼지에서는 ANK1 유전자 내 SNPs는 근육 내 수분 보 존력, pH, 근내지방도와 밀접한 연관성을 보인 것으로 알 려졌다(Hamill 등, 2012; Damon 등, 2013). bovine에서 ANK1 유전자는 chromosome 27 내에 존재하며, Angus, Charolais, Limousin bulls에서 promoter 위치안에 SNP을 확인한 결과, 질감과 유연함, 그리고 근내지방도와 연관성 이 있는 것으로 확인되었다(Aslan 등, 2010; 2013)

Promoter는 RNA 중합효소가 DNA 염기서열에 특이적 으로 결합하는 부위로, 전사개시지점(transcription start site, TSS)을 기준으로 5‘ 방향으로 10~1000bp 길이가 되는 지역에 위치하며 전사를 조절하는 부위이다. Promoter 지 역 내 transcription factor binding site에 존재하는 SNP는 유전자의 발현 시기, 발현 정도 등 유전자 발현에 있어 많 은 영향을 미치는 중요한 요인으로 알려져 있다(Chorley 등, 2008). 유전자 발현에 영향을 미치는 SNP 지역과 경제 형질과의 연관성 분석을 파악 할 수 있을 것이다.

최근 한우에서는 FABP4 유전자를 비롯한(Lee 등, 2011) meat quality 후보 유전자를 대상으로 promoter 지역 내 SNP를 탐색하고 유전자 발현에 미치는 영향에 대해 발견 하여 경제형질들과의 연관성을 연구하고 있다고 보고되고 있다.

현재 ANK1와 다른 품종 간의 meat quality와 관련된 연

구가 보고되어 있으나, 한우와 관련된 연구는 미미한 실정 이다. 본 연구는 후보 유전자로써 ANK1 유전자의 promoter 지역 내 SNP 지역을 탐색하고 각 SNP와 경제형질과의 연 관성을 찾고자 수행하였다.

Ⅱ. 재료 및 방법

1. 공시재료

공시재료는 축산물품질평가원에서 보유한 도체성적이 있는 한우 119두의 조직을 이용하였다. SNP 탐색 및 경제 형질과의 연관성을 분석을 위해 한우 조직으로부터 genomic DNA를 분리 정제하여 119두를 공시재료로 사용 하였다(Table 1).

2. Genomic DNA 추출 및 quality control

Genomic DNA의 추출은 Quickgene Kit(Kurabo Bio- Medical, Osaka, Japan)를 이용하여 1.5ml micro tube에 5mg 정도의 조직을 넣고 tissue lysis buffer 180㎕와 proteinase K 20㎕를 첨가한 55℃에서 12시간 lysis를 실시 하였다. Lysis를 실시 한 후에 10,000rpm에서 3분 동안 원 심분리하여 상층액을 취하고 새로운 1.5ml micro tube에 옮겨 담아 lysis buffer 180㎕을 첨가한 후 15초간 voltex한 다음 70℃에서 10분간 incubation하여 99% ethanol 240㎕

을 넣고 15초간 vortex하였다. 그 후 사용 편람에 따라 분 리정제 하였다. 추출 된 DNA sample 농도는 NanoDrop ND-1000(Nanodrop Technologies, USA)을 이용하여 260nm, 280nm에서 흡광도를 측정하였고, 측정 후 DNA sample은 -20℃에 보관하며 실험에 사용하였다.

Table 1. Overall means and standard deviation (SD), minimum (Min) and maximum (Max) of traits analyzed in this study

Trait No. Mean SD Min Max

CW 119 405.55 55.92 288.00 553.00

BF 119 12.15 4.85 3.00 27.00

LMA 119 93.51 13.45 57.00 132.00

MS 119 5.63 2.78 1.00 9.00

BF; backfat thickness, LMA; longissimus muscle area, CW; carcass weight, MS; marbling score

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Table 2. PCR primers information for identification of polymorphisms in bovine ANK1 promoter

Sequence Tm.

ANK1_1 F 5’-TCCCCAACTCCCAGAGTTTA-3’

R 5’-CCATCACTGACCGGATGAGG-3’ 51℃

ANK1_2 F 5’-TTAGCCTAAAGGTGCCCTGG-3’

R 5’-GCCTACATTGCTGGGGTG-3’ 52℃

3. Polymerase chain reaction

ANK1 TSS(GenBank: AC_000184.1)를 기준으로 1.18Kb 지역을 증폭할 수 있는 2개의 primer를 제작하여 각 primer별로 증폭을 위한 조건을 설정하였다(Table 2). PCR 증폭을 위한 반응 조건은 gemonic DNA 50ng, primer 0.5 μM, dNTP 각 2.5mM 10X buffer(10mM Tris-CL, 50mM KCl, 1.5mM MgCl2, pH 8.3), Taq polymerase 0.2㎕

(10unit/㎕)를 넣고 최종 반응량이 20㎕가 되게 조정한 후 94℃에서 pre-denaturation 5분을 실시하고서, 94℃

denaturation 30초, primer에 적당한 annealing온도에서 30 초, extension 72℃에서 30초로 총 35cycle로 실행 후 final extension을 72℃에서 5분 동안 GeneAmp PCR system 9700(Aplied Biosystems, USA)로 수행하여 증폭된 산물은 EtBr이 포함된 2% agarose gel을 이용하여 증폭여부를 확 인하였다.

4. SNP 탐색 및 유전자형 결정

ANK1 유전자의 SNPs를 탐색하기 위하여 PCR 반응을 실시한 후 정제 과정을 거쳐 ANK1 유전자의 순수 PCR 증 폭 산물을 생산하였다. 생산된 증폭 산물은 BigDye®

Terminatorv 3.1 Cycle Sequencing Kit(Applied Biosystems, USA)를 사용하여 SNPs가 존재하는 PCR 산물 의 염기들마다 형광 dye를 부착해 최종 Purification 과정 을 거쳐 ABI 3130XL Genetic Analyzer(Applied Biosystems, USA)를 통하여 염기서열을 결정하였다. 결정 된 염기서열은 seqMAN Ⅱ(DNA STAR Inc.) 프로그램을

이용하여 각 유전자들에 대한 SNPs를 확인하였다.

5. 통계분석

ANK1 유전자의 변이지역에 대한 경제형질과의 효과를 추정하기 위해 SAS 9.2 package/PC software(SAS, USA) 를 통해 분석을 실시하였다.

Yijk=μ+Gj+eijk

상기모형에서,

Yijk=대상형질에 대한 관측치 μ = 대상형질의 전체 평균 Gj=유전자형(Genotype) 효과 eijk=임의 오차

Ⅲ. 결과 및 고찰

1. ANK1 promoter 지역 내 SNP 탐색

NCBI에 등록된 ANK1 TSS(GenBank: AC_000184.1)기준 으로 promoter 1.1kB를 찾은 후 primer를 제작하여 promoter 내 SNP 지역을 확인하였다. 분석결과 C-944T, C-733T, C-687G, G-672A, T-307C, A-104G, C-24T SNP가 발견되었다. 기존에 보고되었던 SNP인 분석결과 C-944T, C-733T, C-687G, G-672A, T-307C, C-24T은 나타났으나, A-961C 지역의 SNP는 나타나지 않았지만, 본 연구에서 새 로 발견된 A-104G SNP를 확인하였다(Fig. 1).

Fig. 1. SNP map of region 1.18 kb upstream of Hanwoo ANK1 TSS. Black point is new SNP region in this study.

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Table 3. Genotype and allele frequencies of the identified ANK1 gene promoter in Hanwoo (119 samples)

Loci. Genotype

Frequency

A-961T AA AT TT

1 0 0

C-944T CC CT TT

0.94 0.04 0.02

C-733T CC CT TT

0.42 0.42 0.16

C-687G CC CG GG

0.99 0.01 0

A-672G AA AG GG

0.17 0.34 0.50

C-307T CC CT TT

0.39 0.36 0.25

A-104G AA AG GG

0.72 0.24 0.04

C-24T CC CT TT

0.42 0.04 0.54

2. ANK1 promoter 유전자형 분석

Table 3에서 보는 바와 같이 119두의 개체별 유전자형 빈도는 C-944T에서는 CC유전자형(0.94), CT유전자형(0.04), TT유전자형(0.02)으로 확인하였으며, C-733T에서는 CC유 전자형(0.42), CT유전자형(0.42), TT유전자형(0.16)으로 확 인하였다. C-687G에서는 CC유전자형(0.99), CG유전자형 (0.01)으로 나타났으며 GG 유전자형은 확인되지 않았다.

G-672A에서는 AA유전자형(0.17), AG유전자형(0.34), GG 유전자형(0.50)으로 확인하였다. T-307C에서는 CC유전자 형(0.39), CT유전자형(0.36), TT유전자형(0.25)으로 확인하 였다. A-104G은 AA유전자형(0.72), AG유전자형(0.24), GG

유전자형(0.04)로 확인되었으며, C-24T는 CC유전자형 (0.42), CT유전자형(0.04), TT유전자형(0.54)으로 확인하였 다.

3. ANK1 promoter Haplotype 분석

7개의 SNPs를 대상으로 haplotype분석을 실시하였다.

총 3개로 확인되었으며 Table 4에 나타내었다. Ht1(-CA-) 의 빈도는 0.567로 가장 높았으며 Ht2(-TA-)의 빈도는 0.273, Ht3(-TC-)의 빈도는 0.160로 가장 낮았다. 각각의 haplotype과 경제형질간의 연관성 분석한 결과 통계적으 로 유의적이지 못한 것(p>0.05)으로 확인되었다(Fig. 2).

Fig. 2. Linkage disequilibrium plots with the single nucleotide polymorphism within the ANK1 promoter of this study.

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Table 4. Linkage disequilibrium and haplotype structure in the ANK1 gene promoter a) LDs amongANK1 promoter polymorphisms

D’

C-944T C-733T C-687G A-672G C-307T A-104G C-24T

r2

C-944T 0.132 1 0.201 0.18 1 0.205

C-733T 0 1 0.831 0.808 0.782 0.894

C-687G 0 0.002 1 1 1 1

A-672G 0.001 0.596 0.002 0.828 1 0.884

C-307T 0.002 0.292 0.006 0.265 1 0.475

A-104G 0.007 0.068 0.001 0.096 0.249 0.568

C-24T 0.002 0.37 0.005 0.312 0.218 0.078

b) Haplotype structure and frequency inANK1 promoter polymorphisms

Haplotype C-307T A-104G Frequency

Ht1 C A 0.567

Ht2 T A 0.273

Ht3 T G 0.160

Table 5. Least squares means and standard errors for economic traits of genotypes in Hanwoo ANK1 promoter area

SNP Genotype CW BF LMA MS

C-944T

CC 406.63±5.23â 12.41±0.45â 94.16±1.26â 5.69±0.26

CT 413.60±24.76^ab 8.00±2.13^b 81.80±5.95^b 4.80±1.25

TT 325.00±39.15^b 8.00±3.38^ab 86.50±9.40^ab 5.50±1.98

C-733T

CC 396.20±7.86 11.20±0.68 90.80±1.89 4.92±0.39^a

CT 416.58±7.86 13.10±0.68 95.40±1.89 6.00±0.39^ab

TT 401.11±12.75 12.18±1.10 95.68±3.04 6.53±0.63^b

A-672G

AA 406.35±12.52 12.10±1.09 97.45±2.97 6.85±0.61^a

AG 414.48±8.85 12.73±0.77 95.53±2.10 5.90±0.43^ab

GG 399.22±7.29 11.78±0.63 90.81±1.73 5.03±0.35^b

BF; backfat thickness, LMA; longissimus muscle area, CW; carcass weight, MS; marbling score

4. ANK1 promoter SNP와 경제형질 연관성 분석

119두를 대상으로 8개의 변이지역에 대한 개체별 유전 자형 분석결과를 바탕으로 유전자형과 경제형질간의 연관 성 분석을 실시하였다(Table 5). C-944T 지역과 경제형질 간의 연관성을 분석한 결과 도체중, 등지방두께와 등심단 면적에서 유의성을 발견하였다. 도체중에서 CT(413.60±

24.76) 유전자형이 가장 우수했으며 CC(406.63±5.23) 유전 자형, TT(325.00±39.15) 유전자형 순서로 우수하였다 (p<0.05). 등지방두께에서는 CC(12.41±0.45) 유전자형은 CT(8.00±2.13), TT(8.00±3.38)를 보다 높은 점수를 확인하였 다(p<0.05). 등심단면적 또한 CC(5.69±0.26) 유전자형이 가

장 우수했으며 TT(5.50±1.98) 유전자형, CT(4.80±1.25) 순으 로 우수하였다(p<0.05). 그러나 C-944T 위치에서 CC 유전 자형이 CT, TT 유전자형의 frequency가 매우 높아 이러한 결과가 생길 수 있다. C-733T 지역에서 TT(6.53±0.63) 유전 자형에서 근내지방도가 가장 우수했으며, CT(6.00±0.39) 유 전자형, CC(4.92±0.39) 유전자형으로 근내지방도가 낮았다.

G-672A 지역에서 근내지방도와 연관성을 찾을 수 있었는 데 AA(6.85±0.61)유전자형이 AG(5.90±0.43), GG(5.03±0.35) 에 보다 좀 더 우수한 것으로 나타났다(p<0.05).

본 연구는 한우 ANK1 유전자의 promoter 지역에 있는 SNP를 찾아서 경제형질을 분석하였다. Aslan 등(2010)이 연구한 Angus, Charolais, Limousin bulls, crossbred 종에

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서 발견한 SNP 중에 공통적으로 C-944T, C-733T, C-687G, G-672A, T-307C, C-24T 위치에서 한우 또한 SNP가 발견 되었으며, 본 연구 내에서 새로 발견한 A-104G 지역의 SNP를 찾았다. 또한 한우에서 등심단면도, 근내지방도, 등 지방두께 형질과의 연관성이 있는 것을 확인할 수 있었다. 특히 C-733T, G-672A 지역과 근내지방도와의 연관성이 있 는 것을 확인하면서 Aslan 등(2010)이 연구한 것과 동일함 을 알 수 있다. 추후 더 많은 개체수를 가지고 연구가 진행 된다면 한우 분자육종을 위한 기초자료로 사용될 것으로 예상된다.

Ⅳ. 요약

ANK1(Ankyrin 1) 유전자는 소의 27번 염색체에 위치하 고 있으며, cytoskeleton의 기본적인 구성요소를 형성하는 구조 단백질로, spectrin-actin cytoskeleton 기초를 이루는 필수 막 protein의 family protein으로 가축에게 있어 meat quality에 관여하는 후보 유전자로 알려져 있다. ANK1 유 전자의 promoter 지역은 RNA polymerase가 결합하여 전 사를 시작하기 위해 필요한 부분이며 유전자 발현을 조절 하는 지역으로 많은 연구들이 진행되어 오고 있다. 따라서 본 연구는 ANK1 유전자 내 존재하는 promoter 지역의 유 전자변이를 조사하여 유전자형에 따른 한우의 경제형질과 의 연관성을 확인하고자 실시하였다. 경제형질 정보를 가 지고 있는 한우 119두를 대상으로 ANK1 유전자의 promoter 지역을 탐색한 결과, 총 7개의 SNP(C-944T, C-733T, C-687G, A-672G, C-307T, A-104G, C-24T)을 확인 하였으며, 이 중 A-104G 지역을 새로 발견하였다. 3개의 haplotype을 발견하였으나 경제형질과의 연관성은 발견되 지 않았다. C-944T 지역에서 도체중, 등지방두께, 등심단면 적에서 유의적으로 나타났으며(p<0.05), C-733T와 A-672G 지역에서는 근내지방도에서 유의적으로 나타났다(p<0.05).

추후 ANK1 유전자와 근내지방도와의 연관성에 대한 연구 가 더 필요할 것이다.

Ⅴ. REFERENCES

1. Aslan, O., Sweeney, T., Mullen, A. M. and Hamill, R.

M. 2010. Regulatory polymorphisms in the bovine Ankyrin 1 gene promoter are associated with

tenderness and intramuscular fat content. BMC Genetics. 11:111.

2. Aslan, O., Ruth, M., Hamill, R. M., Anne, M., Mullen, A. M., Davey, G. C., Gil, M., Christy, D., Gladney, C.

D. and Sweeney, T. 2012. Association between promoter polymorphisms in a key cytoskeletal gene (Ankyrin 1) and intramuscular fat and water-holding capacity in porcine muscle. Mol. Biol. Rep. 39:3903–

3914.

3. Bennett, V. and Baines, A. J. 2001. Spectrin and ankyrin-based pathways: metazoan inventions for integrating cells into tissues. Physiol. Rev. 81(3): 1353–

1392.

4. Choi, C. B., Shin, H. U., Lee, S. O., Kim, S. I., Jung, K.

K., Choi, C. W., Baek, K. H., Lunt, D. K. and Smith, S.

B. 2008. Comparison of Cholesterol Contents and Fatty Acid Composition in M. longissimus of Hanwoo, Angus and Wagyu Crossbred Steers. J.

Anim. Sci. & Technol. (Kor.) 50(4):519-526.

5. Chorley, B. N., Wang, X., Campbell, M. R., Pittman, G.

S., Noureddine, M. A. and Bell, D. A. 2008. Discovery and verification of functional single nucleotide polymorphisms in regulatory genomic regions:

Current and developing technologies. Mutat. Res.

659(1-2):147–157.

6. Damon, M., Denieul, K., Vincent, A., Bonhomme, N., Wyszynska-Koko, J. and Lebret, B. 2013. Associations between muscle gene expression pattern and technological and sensory meat traits highlight new biomarkers for pork quality assessment. Meat Science.

95(3):744–754.

7. Hamill, R. M., McBryan, J., McGee, C., Mullen, A. M., Sweeney, T., Talbot, A., Cairns, M. T. and Davey, G.

C. 2012. Functional analysis of muscle gene expression profiles associated with tendernessand intramuscular fat content in pork. Meat Science. 92(4):440–450.

8. Kim, B. S., Kim, N. K., Lee, S., Cho, Y. M., Heo, H.

N., Park, E. W., Yang, B. K. and Yoon, D. 2011.

Association study between the polymorphisms of exostosin-1 gene and economic traits in Hanwoo. J.

Anim. Sci. Technol. 53(1):7-13.

9. Lee, S. H., Kim, H. C., Cho, W. M., Chang, S. S., Kim,

(7)

www.earticle.net

B. S., Chang, G. W., Lee, J. H., Yeon, S. H. and Hong, S. K. 2011. Association of genetic polymorphism in fatty acid synthase with body fat and fatty acid composition in Hanwoo. CNU Journal of Agricultural Science. 38(2):257-262.

10. Lee, S. H., Kim, N. K., Kim, S. C., Choi, B. H., Heo, K. N., Lee, C. S., Kim, O. H., Lee, J. H., Kim, H. C.

and Hong, S. K. 2011. Genetic polymorphism in regulatory region of fatty acid binding protein 4 (FABP4) and its effect on carcass weight in Hanwoo steers. CNU Journal of Agricultural Science.

38(4):673-680.b

11. Lee, T. H., Shin, D. H., Cho, S. A., Kang, H. S., Kim, S. H., Lee, H. K., Kim, H. B. and Seo, K. S. 2014.

Genome-wide association study of integrated meat quality-related traits of the Duroc pig breed. Asian Australas. J. Anim. Sci. 27(3):303-309.

12. Levine, M. and Tjian, R. 2003. Transcription regulation and animal diversity. Nature. 424:147-151.

13. McClure, M. C., Morsci, N. S., Schnabel, R. D., Kim, J. W., Yao, P., Rolf, M. M., McKay, S. D., Gregg, S. J., Chapple, R. H., Northcutt, S. L. and Taylor, J. F.

2010. A genome scan for quantitative trait loci influencing carcass, post-natal growth and reproductive traits in commercial Angus cattle. Anim.

Genet. 41:597-607.

14. Oh, J. D., Cheong, I. C., Sohn, Y. G. and Kong, H. S.

2012. Identification of single nucleotide polymorphisms in the ACADS gene and their relationships with economic traits in Hanwoo. CNU Journal of Agricultural Science. 39(2):219-226.

15. Park, B. S. and Yoo, I. J. 1994. comparison of fatty acid composition among imported beef, Holetin steer beef and Hanwoo beef. Korea Food Research Institute. 36(1):69-75.

16. Planas, J. and Serrat, J. M. 2010. Gene promoter evolution targets the center of the human protein interaction network. PLoS One. 5:e11476.

17. Rubtsov, A. M. and Lopina, O. D. 2000. Ankyrins.

FEBS Letters, 482:1-5.

18. Taylor, R. G. and Koohmaraie, M. 1998. Effects of postmortem storage on the ultrastructure of the endomysium and myofibrils in normal and callipyge longissimus. J. Anim. Sci. 76:2811-2817.

19. Van Deveire, K. N., Scranton, S. K., Kostek, M. A., Angelopoulos, T. J., Clarkson, P. M., Gordon, P. M., Moyna, N. M., Visich, P. S., Zoeller, R. F., Thompson, P. D., Devaney, J. M., Heather, G. D., Hoffman, E. P., Maresh, C. M. and Pescatello, L. S. 2012. Variants of the vnkyrin repeat domain 6 gene (ANKRD6) and muscle and physical activity phenotypes among European-derived American adults. Journal of Strength and Conditioning Research. 26(7):1740–1748.

20. Wang, Y. H., Byrne, K. A., Reverter, A., Harper, G.

S., Taniguchi, M., McWilliam, S. M., Mannen, H., Oyama, K. and Lehnert, S. A. 2005. Transcriptional profiling of skeletal muscle tissue from two breeds of cattle. Mammalian Genome. 16:201-210.

21. Wimmers, K., Murani, E., Te Pas, M. F., Chang, K.

C., Davoli, R., Merks, J. W., Henne, H., Muraniova, M., da Costa, N., Harlizius, B., Schellander, K., Boll, I., Braglia, S., de Wit, A. A., Cagnazzo, M., Fontanesi, L., Prins, D. and Ponsuksili, S. 2007. Associations of functional candidate genes derived from gene-expression profiles of prenatal porcine muscle tissue with meat quality and muscle deposition.

Anim. Genet. 38:474–484.

(Received 30 October 2015, Revised 30 May 2016, Accepted 02 June 2016)