한우에서 Myopalladin (MYPN) 유전자의 A1795G SNP의 다형성 및 도체형질 관련성 분석

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한우에서 Myopalladin (MYPN) 유전자의 A1795G SNP의 다형성 및 도체형질 관련성 분석

홍민욱¹․김 훈¹․박새롬¹․이승규¹․이영섭¹․김진우¹․김기범²․이선영³․송영한¹․이성진^1*

강원대학교 동물생명과학대학¹, 축산물품질평가원², 한국마사회³

Association Analysis between A1795G Single Nucleotide Polymorphism (SNP) in Myopalladin (MYPN) Gene and Carcass Traits in Korean Cattle

Min-wook Hong¹, Hun Kim¹, Sairom Park¹, Seung-kyu Lee¹, Yeung-sub Lee¹, Jin-woo Kim¹, Ki-Beom Kim², Sun-Young Lee³, Young-Han Song¹ and Sung-Jin Lee^1*

1College of Animal Life Sciences, Kangwon National University, ²Korea Institute for Animal Products Quality Evaluation,

3Racing Laboratory, Korea Racing Authority

ABSTRACT¹⁾

Myopalladin (MYPN) is an important expression gene associated with regulation of Z-line structure in muscle and maintains sarcomeric integrity. In this study, we investigated the association between MYPN A1795G SNP (single nucleotide polymorphism) and carcass traits (LMA, longissimus muscle area; CW, carcass weight; BF, backfat thickness; MS, marbling score) in Korean cattle. The MYPN A1795G SNP was genotyped in 212 steers and analyzed the associations with carcass traits by PCR-RFLP (Restriction fragment length polymorphism) method. The allele frequencies were 0.566 for G allele and 0.434 for A allele. And the genotype frequencies of GG, GA, and AA genotype were 32.1%, 49%, and 18.9%, respectively. Association analysis indicated that the A1795G SNP of MYPN gene showed a significant association with LMA (p<0.05). The steers with GG genotype had higher LMA than those with the genotypes AA. But no significant associations were observed in other carcass traits (CW, BF, MS). The steers with the GG genotype showed higher CW and BF than those with the genotypes AA and GA. These results suggest that the A1795G SNP of the MYPN gene is associated with LMA and may be useful for candidate marker-assisted selection to increase the levels of LMA in Korean cattle.

(Key words: Myopalladin, SNP, Longissimus muscle area, Korean cattle)

Ι .

서론

현재 캐나다, 미국, 호주 등의 국내유통과 더불어 최근 EU 의 시장개방까지 각 나라의 쇠고기가 국내 시장으로 유통이 활발해지면서 한우 지역브랜드와 정부 차원에서의 한우 쇠 고기의 육질고급화 및 육량증가가 대두되고 있다. 이러한 차 원에서 수입 쇠고기의 국내산 둔갑 또는 구제역 등의 질병 차단, 가축개량과 개선에 기여하기 위한 방법으로 쇠고기 이 력제가 2009년부터 도축, 가공, 판매 등 유통관계가 시행되 어 적용되고 있다.

쇠고기의 등급판정에 있어 소 도체의 품질은 육량 및 육 질로 평가하며 육량은 도체중, 등지방두께 및 배최장근단면 적을 기초로 등급을 판정하고 육질은 근내지방도, 육색, 지 방색, 조직감 및 성숙도 등으로 판정한다. 이 가운데 근내지 방도는 쇠고기의 관능적 특성의 기준이 되는 연도, 다즙성 및 풍미 등과 깊이 관련되어 있어 고급육 생산을 위해서는 근내지방 함량을 높이는 것이 매우 중요하다고 할 수 있다 (신기현 등, 2009).

한편 최근 분자 유전학 기법의 발달로 DNA를 이용한 유 전자분석법이 있는데, 이와 같은 유전자분석법을 이용하여

* Corresponding author: Sung-Jin Lee, Dept. of Animal Biotechnology, College of Animal Life Sciences, Kangwon National University, Chuncheon 200-701, Korea. Tel: +82-33-250-8636, E-mail: [email protected]

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소에 있어 도체형질과의 연관성에 대한 연구가 활발히 진행 되고 있다. 특히 형질관련 유전자 마커 발굴을 위하여 기능 유전자를 대상으로 단일염기다형성(SNP, single nucleotide polymorphism) 발굴 및 형질 관련성 연구가 진행되고 있으 며, 현재까지 다양한 형질관련 SNP들이 발굴되었다(이 등, 2004; Cheong 등, 2007; Kong 등, 2007; Cho 등, 2008; 김 등, 2009). 실 예로 쇠고기 이력제에 이용되고 있는 유전자 분석법인 DNA 동일성 검정은 쇠고기의 이력 정보가 정확 하게 전달되고 있는지를 과학적으로 확인할 수 있는 방법이 다. 이 검사법은 동일 개체는 동일한 DNA 구조로 되어있는 점을 이용하여 도축된 고기와 판매되는 고기가 일치하는지 를 microsatellite marker를 이용하여 loci 별로 대립유전자 의 정확한 크기를 결정하여 확인하는 방법이다.

Myopalladin(MYPN) 유전자는 근절(sarcomere)의 형태 유 지 및 Z-line 구조를 조절하는 다기능 단백질로서 actin 구조 를 조절하는 기능을 가지는 palladin, myotilin과 함께 작은 유 전자군을 이룬다(Goicoechea 등, 2008). 이 palladin-myotilin- myopalladin 유전자군은 유사한 면역 글로불린 항체 영역 [Immunoglobulin (Ig)-like domain]들을 공유하며, 근절 Z-disc의 중요한 구조적 요소이다(Salmikangas 등, 1999;

Parast와 Otey, 2000; Otey 등, 2005; Goicoechea 등, 2008).

면역 글로불린 항체 영역(Ig-domains)은 고도로 정렬된 근 절의 세포골격을 만드는 역할을 하는 단백질군의 특정 영역 이다(Vaughan 등, 1992; Gilbert 등, 1999). 근절은 A-band (Anisotropic band)와 I-band(Isotropic band)라고 하는 2종 의 필라멘트로 구성되어 있는데 MYPN은 새로운 145 kD의 단백질로 암호화되고 Z-line과 I-band의 단백질 조합에서 다양한 역할을 갖는다(Bang 등, 2001; Ma와 Wang, 2002;

McElhinny 등, 2003). 이 단백질은 심장과 골격근의 Z-line 에 주로 존재하고 이들은 제한된 패턴으로 나타난다(Bang 등, 2001). 또한 MYPN 유전자는 척추동물의 Z-line에서 α -actinin과 nebulin을 함께 묶는 역할을 하며(Ma와 Wang, 2002; McElhinny 등, 2003), cardiac ankyrin repeat protein (CARP)에 결합하여 선 모양을 가지는 근절의 중심인 I-band에서 근육의 발현조절에 관련된 핵전사 조절 인자이 다(Bang 등, 2001; Mestroni, 2009). 이 CARP의 결합 부분에 MYPN의 과발현이 나타나게 되면 근절섬유의 심각한 붕괴 를 초래한다. 이러한 결과로 보아 CARP와 MYPN의 상호작 용에 있어서 근원섬유 구조가 근육 유전자 발현과 연관이 있는 것으로 사료된다고 보고하였다(Bang 등, 2001; Knoll 등, 2002).

Jiao 등(2010)은 MYPN 유전자를 이용한 Bos taurus의 도 체형질과의 연관성 연구를 통해 exon 9번에서 SNP를 발견

하여(A1795G) 유전자타입을 확인하고 배최장근단면적 (LMA, longissimus muscle area)에서 유의성을 확인하였으 며, 이 SNP이 소의 번식 및 육종과 관련한 도체형질에 있어 서 좋은 유전적 마커로서 이용될 수 있을 것이라 하였다. 그 러나 한우에서 MYPN 유전자와 도체형질과의 연관성에 대 한 연구는 지금까지 보고된 바가 없다.

따라서 이번 연구는 근절의 유지 및 구조를 조절하는 MYPN 유전자의 SNP을 PCR-RFLP(polymorphism chain reaction-restriction fragment length polymorphism) 및 일 반선형모형(GLM, general linear model)을 이용하여 한우의 유전자타입을 확인하고 주요 도체형질과의 연관성을 분석 하여 기존의 연구와 어떠한 차이가 있는지 확인하였다.

Ⅱ. 재료 및 방법

1. 공시재료

본 연구에 이용된 공시재료는 2009년부터 2010년까지 도 축된 한우 중 212두의 조직시료를 축산물품질평가원에서 제 공받아 이용하였다. 이 한우 조직시료들은 태어난 날부터 도축된 날까지의 나이(년도 기준)가 24~36개월 령인 개체를 이용하였으며, 모두 거세우를 이용하였다. 도체형질 조사 항 목은 도체중(CW, carcass weight), 배최장근단면적(LMA, longissimus), 근내지방도(MS, marbling score), 등지방두께 (BF, backfat thickness) 등 4개 항목에 대한 측정치를 이용 하였으며, 각 개체의 도축정보와 개체정보는 축산물품질평 가원과 농협의 축산정보 홈페이지를 이용하여 정리하였다.

2. 시료의 DNA 동일성 검정

실험에 쓰인 조직시료는 도축하여 등급판정을 받은 시료 와 실험에 사용되는 시료에 대하여 microsatellite marker를 이용한 DNA 동일성 검정법에 의해 확인된 시료만을 택하 여 본 실험에 사용하였다.

3. Genomic DNA의 분리 및 정제

각 공시축의 조직시료로부터 조직을 25 mg을 떼어낸 다 음 genomic DNA의 추출 및 정제는 i-genomic CTB DNA Extraction Mini Kit(Intron Biotechnology, Korea)를 이용하 여 추출하였다. 추출한 genomic DNA는 아가로즈 겔 전기

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Table 1. Primer sequences and fragment size for PCR amplification A1795G SNP genotyping of MYPN

SNP Primer sequences Product

size (bp)

Annealing Tm.

(℃) Amplified region

A1795G F: 5'-CCTTTGGCTCATTTGGTCTGC-3'

416 64 Exon 9

R: 5'-ACTTGCTCATCTGCCACTCACC -3'

영동으로 확인하였으며 분광광도계로 농도를 확인한 다음 PCR의 주형으로 이용하였다.

4. MYPN 유전자의 primer 설계 및 합성

한우 MYPN 유전자의 SNP 실험을 위해 기존에 보고된 Jiao 등(2010)의 연구에서 새롭게 발견된 A1795G SNP의 primer sequence를 확인하여 GeneBank(Accession No.

NC_007329)에서 재차 확인하였다. 실험에 이용된 A1795G SNP primer쌍의 염기서열 정보는 Table 1에 제시한 바와 같다.

5. MYPN 유전자의 PCR 증폭

한우 MYPN 유전자의 A1795G SNP 실험을 위해 총 212 개체의 DNA를 이용하여 PCR 증폭 실험을 수행하였다.

GeneAmp^® PCR System 9700(Applied Biosystems, USA)을 이용하여 다음과 같은 조건으로 실험하였다. PCR 반응은 template DNA 50 ng, primer 각 10 pM, dNTP 각 0.2 mM, MgCl2 2.5 mM, 10X PCR buffer, 그리고 Taq DNA polymerase 2.5 U을 첨가하여 총 PCR 반응액을 20 ㎕로 하 였다. PCR cycle은 최초 95℃에서 5분간 최초변성을 하고 94℃에서 30초, 64℃에서 30초, 72℃에서 30초 씩 총 32cycle 을 반복하였고 마지막으로 72℃에서 10분간 신장을 하고 PCR 반응을 종료하였다.

6. PCR-RFLP 분석에 의한 MYPN A1795G SNP의 유전 자형 확인

기존 Jiao 등(2010)이 발표한 MYPN 유전자의 SNP 유전 자형이 한우에서도 나타나는지 확인하기 위하여 개체별 PCR 증폭산물을 제한효소를 이용하여 절단하였다. PCR 산 물 10 ㎕와 TaqⅠ(Fermentas Life Sciences, USA) 10 U을 이용하여 총량을 20 ㎕로 정하여 65℃에서 1시간 활성화하 여 PCR-RFLP를 이용하여 절단한 뒤 이로 얻어진 DNA 단 편을 확인하기 위해 ethidium bromide 용액으로 염색한

1.5% 아가로스 겔에 전기 영동하여 UV 상에 나타난 DNA 절편 양상을 분석하여 유전자형을 확인하였다.

7. 통계분석

공시축의 도체형질 관련 성적에 대한 MYPN 유전자의 SNP 유전자형 분석에서 allele frequencies는 Cervus Ver.

2.0 program(Marshall 등, 1998)을 이용하였고 통계분석은 SAS 9.2 Package(SAS Institute, USA)를 이용하여 PROC GLM 방법으로 통계 분석하였으며, SNP 유전자형 효과의 유의성이 나타난 형질에 대해서는 Duncan's multiple range test에 의한 유전자형별 유의성 검정을 실시하였다. 통계분 석에 이용한 모형은 다음과 같다.

Yij= µ + Gi + Maj + ℰij

여기서, Yij는 도체형질 관측치, µ는 형질의 전체평균, Gi

는 유전자형 효과, Maj는 측정 나이의 회귀변수, ℰij는 임의 오차를 나타낸다.

Ⅲ. 결과 및 고찰

MYPN 유전자는 Z-line과 I-band 단백질 조합에서 다양 한 역할을 하는 중요한 근절(sarcomere) 단백질이다. 현재까 지 MYPN 유전자와 관련하여 돼지와 사람에 대한 연구가 진행되었는데 특히 인간에서는 MYPN 유전자에 4개의 독립 이형접합체 돌연변이(independent heterozygous mutations) 가 발견되었다는 보고가 있다. 특히 조직학적이고 기능적인 증거조사를 포함한 유전적 연구에서 MYPN 유전자가 특정 형태의 확장성심근변증(dilated cardiomyopathy)과 연관이 있는 것으로 사료된다고 하였다(Duboscq-Bidot 등, 2008).

또한 도체형질 및 근육축적이 태아기 때 돼지의 근육에서 어떠한 기능을 하는지 후보 유전자를 이용한 연관성 분석에 서 MYPN 유전자가 후지(뒷다리) 무게(ham weight)와 살코 기함량(lean contents)에 연관이 있는 것으로 보고된 적이

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있다(Wimmers 등, 2007). 돼지를 이용한 MYPN 유전자의 SNP을 이용한 또 다른 연구에서는 등지방두께(BF)와 등심 단면적(LEA, loin-eye area), 그리고 근육 내 지방 (Intramuscular fat)과 유의적인 영향을 갖는 두 개의 SNP을 발견하였다(Du 등, 2009). 이와 함께 소를 포함한 다른 가축 들에서도 MYPN과의 연관성을 찾기 위한 많은 연구가 진행 되고 있다.

소의 MYPN 유전자는 소 28번 염색체 내 23,826~23,933 Kbp 사이에 위치하고 있으며 22개의 exon을 지니고 있는 유전자로, sequencing을 통해 지금까지 GeneBank에 136개 의 SNP가 보고되었다. 한편, Jiao 등(2010)은 MYPN 유전자 에서 DNA sequencing을 통해 새로운 A1795G SNP를 발견 하여 중국 재래 소를 포함한 7개의 품종에서 도체형질과의 연관성에 대한 실험을 보고한 바가 있다. 본 연구에서는 Jiao 등(2010)이 발표한 MYPN 유전자의 A1795G SNP 정보 를 기초로 하여 한우에서 SNP를 탐색하고 또한 한우의 유 전적 다형성과 도체형질과의 연관성에 대해 연구하였으며, 기존에 보고된 결과와 비교를 실시하였다.

축산물품질평가원으로부터 제공받은 조직 시료로부터 추 출된 DNA를 이용하여 MYPN 유전자의 A1795G SNP를 증 폭시켜 PCR 산물을 얻어냈다. 이렇게 얻어낸 총 길이 416 bp의 산물을 TaqⅠ제한효소로 RFLP 방법을 이용하여 절편 을 절단하여 각 개체간의 차이를 확인하였다(T^CGA).

A1795G SNP를 TaqⅠ제한효소로 절단하게 되면 ‘A>G 돌 연변이’로 인한 총 3개의 절편이 나오게 되는데, AA genotype는 1개의 단편으로 416 bp, GG genotype는 265와

151 bp의 2개의 단편이 나타나고 GA genotype는 416, 265, 151 bp로 이루어진 3개의 단편이 나타나게 된다(Jiao 등, 2010). 다음과 같은 각각의 절편은 1.5% agarose에 전기영동 을 이용하여 크기를 확인하였으며 절편의 전기영동 결과는 Fig. 1에 제시하였다.

Table 2는 PCR-RFLP법으로 거세 한우의 SNP 유전자형 을 분석하여 집단 내 SNP 유전자형 출현율과 대립유전자 빈도를 조사한 결과이다. 앞선 Jiao 등(2010)의 연구에서는 총 7종의 소에서 660마리를 이용한 유전자형 빈도가 GG genotype은 12.9%, GA genotype은 52%로 나타났고, AA genotype은 35.1%로 나타났다. 반면 이번 연구에서는 총 212개의 개체에서 유전자형 빈도는 GA genotype가 104개 로 가장 출현률이 높았고(49%) 다음으로 GG genotype는 68 개인 32.1%로 나타났으며, AA genotype는 40개로 가장 낮 은 출현율인 18.9%를 보여 앞선 연구와 다른 빈도를 보여주 었다. 또한 SNP 대립유전자 빈도를 살펴보면 G 대립유전자 는 0.566, A 대립유전자는 0.434로 G 대립유전자가 다소 높 게 나타나는 것을 볼 수 있었다. 그러나 Jiao 등(2010)의 연 구결과에서 대립유전자 빈도가 G 대립유전자는 0.389로, A 대립유전자는 0.611로 나타나 유전자형 빈도와 마찬가지로 이번 연구와의 차이를 나타냈다. 이번 실험에 쓰인 한우 거 세우 집단의 기대 이형접합성(He)은 0.492로 추정되었고 관 찰 이형접합성(Ho)은 0.491로 나타나 관찰 이형접합성이 0.001만큼 낮게 나타났으며 다형정보지수(PIC)는 0.371로 나 타났다.

Fig. 1. Agarose gel electrophoresis of TaqⅠPCR-RFLP. GG genotype shows two fragments (265 and 151 bp), GA genotype shows three fragments (416, 265 and 151 bp), and AA genotype shows one fragment (416 bp).

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Table 2. Frequencies of genotypes and allele of the MYPN gene in Korean cattle Gene No. of

animals

Frequencies

He¹⁾ Ho²⁾ PIC³⁾

Genotype (n/%) Allele

GG GA AA G A

MYPN

(A1795G) 212 68 (32.1) 104 (49.0) 40 (18.9) 0.566 0.434 0.492 0.491 0.371

1) Expected heterozygosity; ²⁾Observed heterozygosity; ³⁾Polymorphic information contents.

Table 3. Means, standard deviation (SD) and extreme values of phenotypic values measured on carcass traits in Korean cattle

Traits Means SD Minimum Maximum

LMA¹⁾ (cm²) 94.55 13.62 66.00 136.00

CW²⁾ (kg) 425.1 48.15 285 537

BF³⁾ (mm) 11.46 4.94 3.00 32.00

MS⁴⁾ (No 1-9) 6.63 2.16 1.00 9.00

1) LMA, longissimus muscle area; ²⁾CW, carcass weight; ³⁾BF, backfat thickness; ⁴⁾MS, marbling score.

Table 4. Association between A1795G SNP genotypes of MYPN gene from carcass traits of Korean cattle

Traits SNP

p-value

GG GA AA

LMA¹⁾ (cm²) 97.68±1.66^a 93.91±1.39^ab 90.88±1.77^b 0.034468 CW²⁾ (kg) 434.71±6.01 422.16±4.82 416.4±6.61 0.111764 BF³⁾ (mm) 11.74±0.65 10.99±0.43 12.2±0.88 0.362302 MS⁴⁾ (No 1-9) 6.4±0.26 6.82±0.2 6.55±0.41 0.44553

1) LMA, longissimus muscle area; ²⁾CW, carcass weight; ³⁾BF, backfat thickness; ⁴⁾MS, marbling score.

a,b Means with different superscript letters are significantly different (p<0.05).

MYPN SNP 분석에 이용하기 위해 개체별로 측정된 도체 형질은 축산물품질평가원 홈페이지를 참고하였으며 분석에 이용된 공시재료의 도체형질을 Table 3에 제시하였다. 배최 장근단면적(LMA)의 평균값은 94.55 cm²으로 나타나고 최소 값과 최대값은 각각 66 cm²와 136 cm²로 나타났으며, 도체 중(CW)은 평균값이 425.1 kg, 최소값과 최대값은 각각 285 kg, 537 kg으로 나타났다. 등지방두께(BF)는 평균값이 11.46 mm, 최소값과 최대값은 3 mm와 32 mm로 나타났다. 근내 지방도(MS)은 측정치가 1에서 9까지 다양하게 나타났으며 평균은 6.63이 나왔다.

한우에 있어서 MYPN 유전자의 A1795G SNP이 주요 도 체형질에 있어서 어떠한 영향을 미치는지 확인하기 위해 분 석하였다(Table 4). 분석에 이용된 212두의 거세된 한우에 있어서 MYPN 유전자의 A1795G SNP은 배최장근단면적 (LMA)에서 유의적인 효과가 나타났다(p<0.05). 배최장근단 면적(LMA)에서 GG genotype은 97.68 cm², GA genotype은

93.91 cm²로 나타난 반면 AA genotype에서 90.88 cm²로 나 타나 GG genotype가 AA genotype보다 높은 측정치를 보 였다. 반면 Jiao 등(2010)이 7종(399두)의 소를 대상으로 주 요 도체형질의 초음파성적과 MYPN A1795G SNP 유전자형 과의 연관성에 대해 분석한 연구에서 배최장근단면적 (ULMA, ultrasound longissimus muscle area)의 유의성이 관측되었고(p<0.05), 61두의 Qinchuan 종에서 도체성적을 이용한 동일한 실험에서는 등심단면적(LEA)과 보수력 (WHC, water-holding capacity)의 p-value가 각각 0.0156과 0.001이 나타나 유의성을 확인하였다. 이로 미루어보아 Bos taurus 종에서 MYPN 유전자의 A1795G SNP가 배최장근단 면적(LMA)에서 특히 우수한 유전적 특성을 가지는 것으로 사료된다.

한편 MYPN A1795G SNP과 나머지 형질과의 연관성은 나타나지 않았다. 비록 유의적인 차이를 보이지는 않았지만 도체중(CW)에서 GG genotype(434.71 kg)가 AA genotype

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(416.4 kg)보다 더 우수한 것으로 나타났다. 또한 등지방두 께(BF)와 근내지방도(MS)의 경우에는 GA genotype에서 가 장 높은 우수성을 보여주는 것을 확인할 수 있었다. 다만 homo genotype끼리의 비교에서 등지방두께(BF)는 GG genotype를, 근내지방도(MS)에서는 AA genotype를 가지는 개체가 각 형질에서 높은 측정 평균값을 가지는 것을 볼 수 있었다.

이와 같은 결과로 미루어 볼 때 MYPN 유전자는 한우의 육질을 결정하고 선발하는데 있어 중요한 후보 유전자 마커 가 될 수 있을 것이라 사료된다. 그러나 앞서 이루어진 Jiao 등(2010)의 연구와 달리 한 개의 형질에서만 유의성을 보였 기 때문에 나머지 형질에 대한 유의성을 찾기 위해서는 MYPN 유전자의 추가적인 SNP 발굴이 필요할 것이라 사료 되며 추후 더욱 많은 개체군을 대상으로 한 실험이 이루어 져야 할 것으로 요구된다.

Ⅳ. 요약

Myopalladin(MYPN)은 근절(sarcomere)의 유지 및 Z-line 구조를 조절하는 다기능 단백질로 근육과 관련한 유전자 발 현에 중요한 기능을 담당한다. 본 연구에서는 기존에 보고 된 MYPN 유전자의 A1795G SNP과 한우 도체형질과의 연 관성에 대한 분석을 실시하였다. 분석에는 PCR-RFLP법을 이용하였으며 거세우들(n=212)에서 MYPN 유전자의 A1795G SNP에 대한 유전자형을 확인하였다. 한우에서 G와 A 대립유전자빈도는 각각 0.566과 0.434로 나타났으며, 유전 자형 출현빈도는 GG형이 32.1%, GA형 49% 및 AA형은 18.9%로 나타났다. 또한 MYPN 유전자의 A1795G SNP과 주요 도체형질과의 연관성 분석에서는 AA, GA 유전자형보 다 GG 유전자형에서 배최장근단면적의 평균값이 높이 나타 났으며 유의적으로 나타났다(p<0.05). 한편 나머지 형질에서 는 유의성이 없었으나 homo genotype간 비교에서 도체중 과 등지방두께는 GG 유전자형이 우수한 것으로 나타났다.

이번 연구에서 유의성을 찾아내지 못한 형질들의 연관성을 밝히기 위한 추가적인 SNP 발굴 및 연구가 요구되며 추후 더 많은 개체를 대상으로 한 실험이 이루어져야 할 것으로 사료된다. 이와 같은 결과로 미루어보아 MYPN 유전자의 A1795G SNP은 소의 육질을 결정하는 중요한 후보유전자 마커가 될 수 있을 것이라 기대된다.

사사

본 연구는 강원도 농업기술원 특화작목연구개발과제(과 제번호 : 120110184)와 축산물품질평가원의 지원으로 이루 어졌기에 이에 감사드립니다.

Ⅴ. 인용문헌

1. Bang, M. L., Mudry, R. E., McElhinny, A. S., Trombitás, K., Geach, A. J., Yamasaki, R., Sorimachi, H., Granzier, H., Gregorio, C. C. and Labeit, S. 2001. Myopalladin, a novel 145-kilodalton sarcomeric protein with multiple roles in Z-disc and I-band protein assemblies. J. Cell Biol. 153:413-427.

2. Cheoung, H. S., Yoon, D., Kim, L. H., Park, B. L., Lee, H. W., Han, C. S., Kim, E. M., Cho, H., Chung, E. R., Cheong, I. and Shin, H. D. 2007. Titin-cap (TCAP) polymorphisms associated with marbling score of beef.

Meat Sci. 77:257-263.

3. Cho, S., Park, T. S., Yoon, D., Cheong, H. S., Namgoong, S., Park, B. L., Lee, H. W., Han, C. S., Kim, E. M., Cheong, I. C., Kim, H. and Shin, H. D. 2008.

Identification of genetic polymorphisms in FABP3 and FABP4 and putative association with back fat thickness in Korean native cattle. BMB reports. 41:29-34.

4. Du, D. S., Zhai, L. W., Xu, D. A., Wang, C. D. 2009.

SNPs detection of EPOR & MYPN gene and association with meat quality traits in porcine. Acta Vet. Zootech.

Sin. 36:80-83.

5. Duboscq-Bidot, L., Xu, P., Charron, P., Neyroud, N., Dilanian, G., Millaire, A., Bors, V., Komajda, M. and Villard, E. 2008. Mutations in the Z-band protein myopalladin gene and idiopathic dilated cardiomyopathy. Cardiovasc. Res. 77:118-125.

6. Gilbert, R., Cohen, J. A., Pardo, S., basu, A. and Fischman, D. A. 1999. Identification of the A-band localization domain of myosin binding proteins C and H (MyBP-C, MyBP-H) in skeletal muscle. J. Cell. Sci.

112:69-79.

7. Goicoechea, S. M., Arneman, D., Otey, C. A. 2008. The role of palladin in actin organization and cell motility.

Cell Biol. 87:517-525.

8. Jiao, Y., Zan, L. S., Liu, Y. F., Wang, H. B. and Guo, B.

(7)

www.earticle.net

L. 2010. A novel polymorphism of the MYPN gene and its association with meat quality traits in Bos taurus. Genet. Mol. Res. 9(3):1751-1758.

9. Knöll, R., Hoshijima, M. and Chien, K. R. 2002. Z-line proteins: implications for additional functions. Eur.

Heart J. Suppl. 4:I13-I17.

10. Kong, H. S., Oh, J. D., Lee, J. H., Yoon, D. H., Choi, Y. H., Cho, B. W., Lee, H. K. and Jeon, G. J. 2007.

Association of sequence variations in DGAT 1 gene with economic traits in Hanwoo (Korea cattle).

Asian-Aust. J. Anim. Sci. 20:817-820.

11. Ma, K. and Wang, K. 2002. Interaction of nebulin SH3 domain with titin PEVK and myopalladin:

implications for the signaling and assembly role of titin and nebulin. FEBS Lett. 532:273-278.

12. Marshall, T. C., Slate, J., Kruuk, L. E. B., Pemberton, J.

M. 1998. Statistical confidence for likelihood-based paternity inference in natural populations. Mol. Ecol.

7:639-655.

13. McElhinny, A. S., Kazmierski, S. T., Labeit, S. and Gregorio, C. C. 2003. Nebulin: the nebulous, multifunctional giant of striated muscle. Trends Cardiovasc. Med. 13:195-201.

14. Mestroni, L. 2009. Phenotypic heterogeneity of sarcomeric gene mutations: a matter of gain ad loss? J.

Am. Coll. Cardiol. 54:343-345.

15. Otey, C. A., Rachlin, A., Moza, M., Arneman, D. and Carpen, O. 2005. The palladin/myotilin/myopalladin family of actin-associated scaffolds. Int. Rev. Cytol.

246:31-58.

16. Parast, M. M. and Otey, C. A. 2000. Characterization of palladin, a novel protein localized to stress fivers and cell adhesions. J. Cell Biol. 150:643-656.

17. Salmikangas, P., Mykkänen, O. M., Gronholm, M.,

Heiska, L., Kere, J. and Carpén, O. 1999. Myotilin, a novel sarcomeric protein with two Ig-like domains, is encoded by a candidate gene for limb-girdle muscular dystrophy. Hum. Mol. Genet. 8:1329-1336.

18. Vaughan, K. T., Weber, F. E. and Fischman, D. A.

1992. cDNA cloning and sequence comparisons of human and chicken muscle C-protein and 86 kD protein. Symp. Soc. Exp. Biol. 46:167-177.

19. Wimmers, K., Murani, E., Te Pas, M. F., Chang, K. C.

Davoli, R., Merks, J. W. M., Henne, H., Muraniova, M., Da Costa, N., Harlizius, B., Schellander, K., Böll, I., Braglia, S., De Wit, A. A. C., Cagnazzo, M., Fontanesi, L., Prins, D., Ponsuksili, S. 2007. Associations of functional candidate genes derived from gene- expression profiles of prenatal porcine muscle tissue with meat quality and muscle deposition. Anim.

Genet. 38:474-484.

20. 김남국, 김건석, 정유성, 문희주, 조용민, 윤두학. 2009.

한우 Inositol 1,4,5,-triphosphate Receptor Type 1 (IP3R1) 유전자의 다형성 및 형질 관련성 분석. 한국동물자원과 학회지. 51(4):289-294.

21. 농협 축산정보. Available: http://chuksan.nonghyup.

com/main/subetc_login_management.html

22. 신기현, 신성철, 정구용, 정의룡. 2009. 한우 아포지단백 질 E(APOE) 유전자의 SNP Marker가 육량 및 육질형질 에 미치는 영향. 한국축산식품학회지. 29(1):108-113.

23. 이한주, 이승환, 조용민, 윤호백, 전봉균, 오성종, 권무식, 윤두학. 2004. 한우 lipoprotein lipase 유전자 intron 5번의 polymorphism과 경제 형질과의 관련성 분석. 한국동물 자원과학회지. 46:947-956.

24. 축산물품질평가원. Available: http://www.apgs.co.kr/

(투고일: 2011.10.12. 수정일: 2011.11.24. 판정일: 2011.11.25.)