829
Copyright © 2017 The Korean Society of Fisheries and Aquatic Science pISSN:0374-8111, eISSN:2287-8815
서 론
어란과자치어를대상으로한분자동정은이들이가지는소수 의형태형질로인한동정의어려움을극복하고
,
기존에형태가 밝혀지지않은어란,
자치어의종동정을목적으로실시되고있 으나,
어란과자치어의군집을대상으로한연구는아직까지일 반화되지않고있다.
이와관련하여DNA barcode
는종을동정 하는데게놈내표준이되는짧은유전자염기서열을가리키며,
동물또는식물의종동정을위해사용되고있다(Hebert et al., 2003).
특히,
어류를포함한동물들의종동정을위하여mito- chondrial DNA
내cytochrome c oxidase subunit I (COI)
유전 자염기서열내에있는종특이적인(species specific)
정보를이 용하고있으며,
전세계에서식하는다양한어종들을대상으로 염기서열자료들이축적되고있다(Ratnasingham and Hebert, 2007).
또한국내에서도COI
유전자염기서열을토대로특정종이나과의동정및분포에대한연구를수행한바있다
(Lee
and Kim, 2014a; Lee and Kim, 2014b; Lee and Kim, 2016).
한편
, PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction frag- ment length polymorphism)
는다양한생물들의식별을위한 유전자마커로활용되고있다.
예를들면,
시장에서판매되는 어육의종동정(Cocolin et al., 2000; Dooly et al., 2005)
이나이 매패류(Bivalvia)
와복족류(Gastropoda)
의종동정(Wang et al., 2006)
에도사용된바있다.
이연구에서는현장채집시에다수어종의어란이대량으로채집될경우
, PCR-RFLP
방법을이용한전단계스크리닝
(pre-screening)
을통하여이들어란개체들 의동일종유무를우선확인함으로써염기서열결정에드는노 력과비용을최소화하고자연구를진행하였다.
이연구는부유성어란으로부터얻은
COI
유전자의PCR
산물을
RFLP
방법을이용하여부유성어란을우선그룹화한다음,
각그룹을대표하는개체를대상으로염기서열결정을한후종 동정을실시하였으며
,
이결과를바탕으로제주도사계연안부 유성어란의종조성,
출현시기,
출현량을조사함으로써이해역제주도 사계연안 어란의 분자동정과 격월별 출현양상
한송헌·김맹진·김준상 1 ·송춘복 2 *
국립수산과학원 서해수산연구소, 1한국수산자원관리공단 제주지사, 2제주대학교 해양과학대학
Molecular Identification and Bimonthly Abundance of Fish Eggs Collected in the Coastal Waters of Sagye, Jejudo Island
Song-Hun Han, Maeng Jin Kim, Joon Sang Kim
1
and Choon Bok Song2
*Fisheries Resources and Environment Division, National Fisheries Research and Development Institute, Incheon 22383, Korea
1Korea Fisheries Resources Agency, Jeju Branch, Jeju 63005, Korea
2College of Ocean Sciences, Jeju National University, Jeju 63243, Korea
This study investigated the species composition and abundance of floating fish eggs to determine the timing and loca- tion of spawning of fish inhabiting the coastal waters of Sagye, Jejudo Island. Eggs were collected with a Bongo net bimonthly from May 2009 to February 2010. Identifications were based on nucleotide sequences of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene. Eggs were determined to belong to 43 distinct taxa, 35 of which were identified to the species level. The assemblage spanned eight orders, 23 families, and 32 genera. The number of taxa collected varied from month to month, with 14 taxa (12 species) found in June 2009, 11 taxa (10 species) in October 2009, 10 taxa (nine species) each in August 2009 and February 2010, eight taxa (six species) in April 2009, and five taxa (four species) in December 2009. Five abundant species (Branchiostegus japonicus, Engraulis japonicus, Pseu- dolabrus sieboldi, Goniistius zonatus, and Halichoeres tenuispinis) together represented 52.8% of the total number of eggs collected during the study.
Key words: Fish eggs, Identification, Molecular biology, Jejudo Island
This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Non-Commercial Licens (http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/) which permits unrestricted non-commercial use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
https://doi.org/10.5657/KFAS.2017.0829 Korean J Fish Aquat Sci 50(6) 829-836, December 2017
Received 19 October 2017; Revised 27 November 2017; Accepted 5 December 2017
*Corresponding author: Tel: +82. 64. 754. 3471 Fax: +82. 64. 756. 3493
E-mail address: [email protected]
시료 채집
이번조사는제주도사계연안
(33°13′N, 126°19′E)
에서2009
년4
월부터2010
년2
월까지격월로실시하였다(Fig. 1).
어란 채집을위해봉고네트(
직경0.6 m,
길이2 m,
망목333 μm)
를2-3 knots
의속도로약10
분간표층에서예인하였으며,
어 란의단위면적당 출현개체수는 채집시 네트 입구에유량계(HYDRO-BIOS flowmeter)
를부착하여해수1,000 m
3당개체 수(ind./1,000 m
3)
로환산하여나타내었다.
채집된시료는선상 에서70% ethanol
로고정한후실험실로운반하였다.
조사기 간동안조사해역내환경요인의시기별변동을관찰하기위해 서채집시기마다수질측정기(YSI, USA)
를이용하여표층수온 및염분농도를측정하였다.
Total DNA 추출
DNA
추출을위해70% ethanol
에고정된어란을1.5 mL ep- pendorf tube
에한개씩넣은후micropipet tip
을이용하여어란 을분쇄하였다.
분쇄한어란에tissue lysis buffer (Bioneer Inc., Korea) 50 μL
와0.2 μg/μL proteinase K (Bioneer Inc., Korea) 4 μL
를첨가한후항온수조60℃
에서1
시간동안반응하였다.
반응산물은binding buffer (Bioneer Inc., Korea) 50 μL
를첨 가한후항온수조60℃
에서10
분동안반응한후, 100% iso- propanol (Sigma, USA) 25 μL
를넣고잘혼합한다음, DNA binding column (Bioneer Inc., Korea)
으로옮겨주었다.
이후의 과정은Accuprep Genomic DNA Extraction Kit (Bioneer Inc., Korea)
에제시한방법을따랐다. DNA
의농도와순도는분광광 도계Unicam UV/VIS Spectrometer (Heλios β, Unicam Ltd., UK)
를이용하여흡광도를측정하여확인하였다.
PCR 증폭
PCR
증폭은COI
유전자주변tRNA
서열에기초하여디자인 된forward primer (Asn_F, 5'-YGATCCYRCAAAHWCTTAGT- TAACAGCTAA-3')
와reverse primer (Ser_R, 5'-GGGGTTC- DAYTCCYYCCTTTCT-3')
를 사용하였다. PCR
반응은 최종volume
을40 μL
로하였으며, 10 mM Tris-HCl (pH 8.3)
과50 mM KCl, 2 mM MgCl
2, 0.2 mM dNTP mix, 0.5 mM of each primer, 50 ng template DNA solution, 1 U Ex Taq DNA poly- merase (Takara, Japan)
를 포함하여TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice (TP600, Takara Bio Inc.)
를이용하여실시하였다. PCR
반응은최초denaturing step
으로94℃
에서1
분동안1
회 반응시켰으며,
그후94℃
에서30
초, primer annealing
을위해54℃
에서1
분, primer extension
을위하여72℃
에서1
분50
초의조건으로총
34
회의반복주기를주었으며,
최종적으로72℃
에서
7
분동안extension
을실시하였다. PCR
산물은1X TAE buffer
에0.5 mg/μL ethidium bromide
가첨가된0.8% agarose (LE agarose, Cambrex co.) gel
에서전기영동하여확인하였다. PCR
증폭이확인된산물은AccuPrep Gel Pruification Kit (Bi- oneer Inc., Korea)
를이용하여정제하였다.
제한효소 처리
정제된
COI
유전자 증폭산물은 제한효소HinfI (Bioneer Inc., Korea)
와Hpy188I (NEB Inc., UK)
을이용하여처리하였 다. HinfI
반응은50 mM Tris-HCl (pH 7.6)
과10 mM MgCl
2, 100 mM NaCl, 1 mM DTT, 10 ng PCR
산물, 1 U HinfI
을포함 하여최종volume
을15 μL
로실시하였다. Hpy188I
반응도최 종volume
을15 μL
로하였으며, 20 mM Tris-acetate (pH 7.9)
와50 mM potassium acetate, 10 mM Mg acetate, 1 mM DTT, 10 ng PCR
산물, 1 U Hpy188I
을포함시켰다.
이들제한효소의 반응온도및시간은37℃
에서2
시간실시하였다.
제한효소반 응산물은1X TAE buffer
에0.5 μg/μL ethidium bromide
가첨 가된2% agarose (LE agarose, Cambrex co.) gel
에서전기영동 하여band
양상을확인하였다.
동일한band
양상을보이는어 란개체들을동일한종으로간주하여그룹화하였으며,
그룹화된
PCR
증폭산물중하나를선택하여염기서열결정을한후종동정에사용하였다
. 염기서열 결정 및 종동정
염기서열은
PCR-RFLP
로그룹화된어란중하나의PCR
산 물을Big Dye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kits
와ABI 3730xl DNA Analyzer (Applied Biosystems, USA)
를이용하 여결정하였다.
이를통해얻은COI (
약1,551 bp)
염기서열들 은DNAssist program 2.2 (Patterton and Graves, 2000)
를이 용하여다중정렬한후육안으로 확인하였다.
종동정(species identification)
은어란으로부터얻은염기서열과성어의염기서 Fig. 1. A map showing a sampling site located at the coastal waters of Sagye, Jejudo Island.120˚ 50′ 129˚ 10′
Sampling location
126˚ 30′ 127˚ 00′
126˚ 00′
33˚ 15′
Jejudo Island
33˚ 45′
30 31 32 33 34 35
5 10 15 20 25 30
Apr. Jun. Aug. Oct. Dec. Feb.
Salinity (psu)
Temperature ( ℃ )
Month
Temp.
Sal.
0.74
0.37
0.66 0.52
0.81
0.41 0
0.2 0.4 0.6 0.8 1
Apr Jun Aug Oct Dec Feb
Dominant
Month 1.47
2.21
1.68 1.95
1.18
2.09
0 0.5 1 1.5 2 2.5
Diversity
0.71 0.82
0.73 0.81
0.74
0.91
0 0.2 0.4 0.6 0.8 1
Evenness
제주도 사계연안 어란의 분자동정과 격월별 출현양상
831
열비교를통해실시하였으며종수준의분류가어려울경우에 는일부
GenBank database
를활용하여채집어란으로부터얻 은염기서열과의유전적거리와작성된계통수에서의계통분류 학적인위치를고려하여종(species),
속(genus),
과(family)
또 는목(order)
수준까지분류를실시하였다.
유전적거리차이는Kimura-2-parameter distance model (Kimura, 1980)
로계산하 였으며,
계통수는MEGA6 (Tamura et al., 2013)
의Neighbor- Joining
방법(Saitou and Nei, 1987)
을이용하였다.
군집구조 분석 및 환경요인과의 상관관계
조사기간동안채집된어란의출현종과단위면적당출현개체 수를토대로종다양도지수
(Shannon and Weaver, 1963),
균등 도지수(Pielou, 1966),
우점도지수(McNaughton, 1967)
를계산 하여비교분석하였으며,
수온과염분이어란의출현종수나출 현개체수에미치는영향을알아보기 위해서SPSS (Ver 14.0 SPSS Inc.)
를이용하여피어슨상관관계값(Pearson correla- tion coefficient
또는Pearson’s r)
을구하고,
이들값의통계학 적인유의성검증을실시하였다.
결 과
수온과 염분
조사기간동안수온과염분농도의변동상황은
Fig. 2
에나타 내었다.
먼저조사기간 중수온은14.9-28.2℃
의범위였으며,
평균수온은19.2℃
였다. 2010
년2
월의수온이가장낮았으며, 2009
년8
월에가장높았다.
염분농도는최소31.2 psu (2009
년8
월)
에서최대34.3 psu (2009
년12
월)
의범위였으며,
평균 염분은33.0 psu
를나타냈다.
수온과염분의상관관계를조사 한결과이들은매우강한음의상관관계를보였다(r=-0.916, P<0.01).
종동정과 출현현황
형태학적구분이비교적쉬운멸치어란을제외하고
,
조사기 간동안사계연안에서채집된전체301
개의어란가운데275
개로부터COI PCR
증폭산물(91.4%)
을얻을수있었다.
증폭 된PCR
산물을대상으로RFLP
를이용하여그룹화한다음,
염 기서열분석을통해서종을동정을하였다.
그결과,
조사기간 동안채집된어란의출현현황은Table 1
에나타내었다.
이들어 란들은전체43
개의분류군으로구분되었고,
이중35
종(8
목23
과32
속)
은종수준까지동정이이루어졌다(81.8%).
또한종수 준에서정확하게동정되지못한8
종가운데2
종은과(family)
까지,
그리고1
종은목(order)
까지동정할수있었으나, 5
종은 미동정되었다.
출현어란을분류군으로 구분하면목(Order)
수 준에서농어목(Perciformes)
어류가14
과24
종(
미동정1
종)
으 로가장많았으며,
다음으로는가자미목(Pleuronectiformes)
어 류가2
과3
종(
미동정1
종),
홍메치목(Aulopiformes)
어류가2
과
3
종의순으로출현하였다.
그외에도청어목(Cupeiformes),
첨치목(Ophidiiformes),
대구목(Gadiformes),
쏨뱅이목(Scor- paeniformes),
복어목(Tetraodontiformes)
어류가출현하였다.
과(Family)
수준에서는,
놀래기과(Labridae)
어류가7
종으로가 장많이출현하였고,
그다음으로는도미과(Sparidae)
어류가3
종으로출현하였다.
그외에매퉁이과(Synodontidae),
돌대구 과(Moridae),
옥돔과(Malacanthidae),
다동가리과(Cheilodac- tylidae),
돛양태과(Callionymidae)
어류가각각2
종씩출현하 였으며,
나머지과들은모두1
종씩포함하였다.
출현종 및 출현량
조사기간동안어란의개체수로나타낸시기별단위면적당출 현개체수
(ind./1,000 m
3)
과출현종은Fig. 3
과Table 1
에나타 내었다.
전체단위면적당출현개체수는5,590
개체였으며,
시기 별로2009
년8
월에2,344
개체로가장많은어란이채집되었고,
다음으로는2009
년10
월에1,693
개체, 2010
년2
월에675
개체, 2009
년6
월에406
개체, 12
월에254
개체, 4
월에219
개체가채 집되어상대적으로고수온기인8
월과10
월에많은출현개체수 를보였다.
시기별로채집된어란의분류군수는
2009
년6
월에14
개의분 류군(12
종)
으로가장많은분류군이출현하였고, 2009
년10
월 에는11
개의분류군(10
종), 2009
년8
월과2010
년2
월에는동일 하게10
개분류군(9
종)
이채집되었으며, 2009
년4
월과12
월에 는각각8
개의분류군(6
종)
과5
개의분류군(4
종)
이출현하였다.
채집된어란가운데출현개체수에있어서가장많은어종은 옥돔(Branchiostegus japonicus)
으로2009
년8
월에912
개체가 출현하였으며,
전체출현개체수의16.3%
를차지하였다.
다음 으로멸치(Engraulis japonicus)
가2009
년4
월, 8
월과2010
년2
월에총668
개체(11.9%),
무점황놀래기(Pseudolabrus eoethi- nus)
가2009
년10
월과12
월에총631
개체(11.3%),
아홉동가리(Goniistius zonatus)
가2009
년10
월에388
개체(6.9%),
놀래기(Halichoeres tenuispinis)
가2009
년10
월과12
월에총359
개체(6.4%)
로출현하여,
이들상위5
종이전체출현개체수의52.8%
를차지하였다
.
Fig. 2. Bimonthly variation of surface water temperature (℃) and salinity (psu) at the sampling location.
120˚ 50′ 129˚ 10′
33˚ 20′
Sampling location
126˚ 30′ 127˚ 00′
126˚ 00′
33˚ 15′
Jejudo Island
33˚ 45′
30 31 32 33 34 35
5 10 15 20 25 30
Apr. Jun. Aug. Oct. Dec. Feb.
Salinity (psu)
Temperature ( ℃ )
Month
Temp.
Sal.
0.74
0.37
0.66 0.52
0.81
0.41 0
0.2 0.4 0.6 0.8 1
Apr Jun Aug Oct Dec Feb
Dominant
Month 1.47
2.21
1.68 1.95
1.18
2.09
0 0.5 1 1.5 2 2.5
Diversity
0.71 0.82
0.73 0.81
0.74
0.91
0 0.2 0.4 0.6 0.8 1
Evenness
Cupeiformes Engraulidae Engraulis japonicus 6 - 646 - - 16 668(11.9)
Aulopiformes Aulopodidae Aulopus japonicus - - - 35 - - 35(0.6)
Synodontidae Saurida wanieso - 5 - - - - 5(0.1)
Trachinocephalus myops - - - 212 - - 212(3.8)
Ophidiiformes Ophidiidae Hoplobrotula armata - - 31 35 - - 66(1.2)
Gadiformes Moridae Lotella phycis - - - - 14 27 41(0.7)
Moridae sp. - - - - - 83 83(1.5)
Scorpaeniformes Platycephalidae Platycephalus indicus - 5 - - - - 5(0.1)
Perciformes Moronidae Lateolabrax japonicus - - - - - 83 83(1.5)
Serranidae Caprodon schlegelii 65 - - - - 164 229(4.1)
Callanthiidae Callanthias japonicus 98 65 - - 27 83 274(4.9)
Malacanthidae Branchiostegus albus - - - - - 27 27(0.5)
Branchiostegus japonicus - - 912 - - - 912(16.3)
Sparidae Acanthopagrus schlegeli - 54 - - - - 54(1.0)
Evynnis japonica - - - 35 - - 35(0.6)
Sparus sarba 6 - - - - - 6(0.1)
Mullidae Upeneus japonicas - 16 - - - - 16(0.3)
Kyphosidae Girella punctate - 43 - - - - 43(0.8)
Oplegnathidae Oplegnathus fasciatus - 76 - - - - 76(1.4)
Cheilodactylidae Goniistius quadricornis - - - 106 - - 106(1.9)
Goniistius zonatus - - - 388 - - 388(6.9)
Labridae Halichoeres tenuispinis - 76 283 - - - 359(6.4)
Pseudolabrus eoethinus - - - 494 137 - 631(11.3)
Pseudolabrus sieboldi - - - 247 69 - 316(5.7)
Semicossyphus reticulatus - 16 - - - - 16(0.3)
Stethojulis terina - - 189 - - - 189(3.4)
Suezichthys gracilis - 11 - - - - 11(0.2)
Xyrichtys dea - - 31 71 - - 102(1.8)
Pinguipedidae Pinguipedidae sp. - 5 - - - - 5(0.1)
Callionymidae Neosynchiropus ijimae - 5 - - - - 5(0.1)
Repomucenus virgis - - - - - - 27(0.5)
Trichiuridae Trichiurus japonicus - - 31 35 - - 66(1.2)
Scombridae Auxis rochei - - 63 - - - 63(1.1)
Pleuronectiformes Paralichthyidae Paralichthys olivaceus 26 22 - - - - 159(2.8)
Pseudorhombus pentophthalmus 6 - - - - - 6(0.1)
Pleuronectidae Eopsetta grigorjewi - - - - - - 55(1.0)
Pleuronectiformes sp. - 5 - - - - 5(0.1)
Tetraodontiformes Diodontidae Diodon holocanthus - - 94 - - - 94(1.7)
Unidentified sp. A 6 - - - - - 6(0.1)
Unidentified sp. B 6 - - - - - 6(0.1)
Unidentified sp. C - - 63 - - - 63(1.1)
Unidentified sp. D - - - 35 - - 35(0.6)
Unidentified sp. E - - - - 7 7 7(0.1)
Total no. of eggs (%) 219
(3.9) 406 (7.3) 2,343
(41.9) 1,693 (30.3) 254
(4.5) 254
(4.5) 5,590
(100.0)
Number of taxa examined 8 14 10 11 5 5 43
Number of species identified 6 12 14 10 4 4 35
-, non-appearance.
제주도 사계연안 어란의 분자동정과 격월별 출현양상
833
채집시기별로는
2009
년4
월에가장많은개체가채집된종 은노랑벤자리(Callanthias japonicus)
로4
월에98
개체(44.7%)
가출현하였으며, 6
월에는돌돔(Oplegnathus fasciatus)
과놀래 기가동일하게76
개체씩출현하였고,
각각6
월출현개체수의18.7%
를차지였다. 8
월에는전체출현개체수에서도가장많았던옥돔
912
개체(38.9%)
가출현하였다. 10
월과12
월에는두시 기모두무점황놀래기가가장많이출현하였고,
각각494
개체(29.2%)
와137
개체(53.9%)
가출현하였다. 2010
년2
월에는붉 벤자리(Caprodon schlegelii)
가164
개체(24.3%)
출현하여가 장많았다.
생태지수의 변동
채집시기에 따른 어란의 출현종수와 단위면적당 출현개체 수를바탕으로종다양성지수
,
균등도지수,
우점도지수를구하 였으며그결과는Fig. 4
에나타내었다.
먼저종다양성지수는1.18-2.21
의범위로2009
년6
월에2.21
로가장높았으며, 2009
년12
월에1.18
로가장낮았다.
균등도지수는0.71-0.91
의범위 에서변동하였고, 2010
년2
월에0.91
로가장높았으며, 2009
년6
월에0.82, 10
월에0.81, 12
월에0.74, 8
월에0.73, 4
월에0.71
순으로나타났다.
우점도지수는0.38-0.81
의범위에서변동하 였고, 2009
년12
월과0.81
로가장높았으며,
다음으로는4
월에0.74
로나타났다.
그외의시기에는2009
년8
월에0.66, 10
월에0.52, 2010
년2
월에0.41, 6
월0.38
순으로나타났다.
환경요인과의 상관관계
환경요인인 수온과염분이채집된어란의출현개체수와종
Fig. 3. Bimonthly abundance of fish eggs collected at the sampling location of the coastal waters of Sagye, Jejudo Island. Values in paren- theses indicate the number of species.
254
1-250 250-500 500-1,000 >2,000 (ind./1,000 m)
Dec, 2009 219
33˚ 15′
126˚ 00′ 127˚ 00′
126˚ 00′
Feb, 2009 Oct, 2009
Jun, 2009 Aug, 2009
Apr, 2009
1,693 675
2,344 406
1,000-2,000
126˚ 00′ 127˚ 00′
126˚ 00′
126˚ 00′ 127˚ 00′
126˚ 00′
33˚ 45′
33˚ 15′
33˚ 45′
Fig. 4. Diversity, evenness and dominance indices of fish eggs col- lected during this study.
120˚ 50′ 129˚ 10′
33˚ 20′
Sampling location
126˚ 30′ 127˚ 00′
126˚ 00′
33˚ 15′
Jejudo Island
33˚ 45′
30 31 32 33 34 35
5 10 15 20 25 30
Apr. Jun. Aug. Oct. Dec. Feb.
Salinity (psu)
Temperature ( ℃ )
Month
Temp.
Sal.
0.74
0.37
0.66 0.52
0.81
0.41 0
0.2 0.4 0.6 0.8 1
Apr Jun Aug Oct Dec Feb
Dominant
Month 1.47
2.21
1.68 1.95
1.18
2.09
0 0.5 1 1.5 2 2.5
Diversity
0.71 0.82
0.73 0.81
0.74
0.91
0 0.2 0.4 0.6 0.8 1
Evenness
수에미치는영향을알아보기위하여
Pearson’s r
값으로나타 낸상관계수와유의성검증을실시하였다.
그결과수온과출현 개체수는상관계수가0.897
로양의상관관계를나타내었으며(P<0.05),
염분과출현개체수는-0.910
으로유의한음의상관 관계를보였다(P<0.05).
그러나출현종수와환경요인과의관계 에서는수온과염분,
모두에서상관계수가각각0.209
와-0.428
를나타내어유의한결과를나타내지않았다(P>0.05).
주요 어종의 출현 시기 및 수온 범위
이번조사에서채집된어란들의출현시기와단위면적당출현 개체수
(Table 1)
그리고채집시수온(Fig. 2)
을종합하여기술 하면,
노랑벤자리는2009
년4
월, 6
월, 12
월, 2010
년2
월에총4
회출현하였으며, 14.9-18.4℃
수온범위에서출현하였다.
멸 치의경우, 2009
년4
월, 8
월, 2010
년2
월에총3
회출현하였 고,
가장넓은수온범위(14.9-28.2℃)
에서출현하였으며,
수온 이가장높았던8
월에가장많이나타내었다.
넙치(Paralichthys olivaceus)
는2009
년4
월, 6
월, 2010
년2
월에수온범위14.0-
16.2℃
에서 출현하였으며,
멸치와반대로 수온이 가장 낮은2010
년2
월에가장많은출현개체수를나타내었다.
과(Family)
중가장많은출현개체수(29.1%)
와종수(7
종)
를나타낸놀래기 과는종에따라차이는있지만, 2009
년6
월부터2009
년12
월까 지수온범위16.4-28.2℃
에서출현하였으며,
그중출현개체수 가가장많은무점황놀래기의경우에는2009
년10
월과12
월에 수온범위16.4-20.7℃
에서출현하였다.
조사시기동안가장많 은출현개체수를나타낸옥돔은수온이가장높았던2009
년8
월(28.2℃)
에1
회출현하였으며,
같은과에속하는옥두어의경 우에는가장수온이낮았던2010
년2
월(14.9℃)
에출현하여대 조를이루었다.
그외에경제성어류인농어
(Lateolabrax japonicus),
감성돔(Acanthopagrus schlegeli),
벵에돔(Girella punctata),
돌돔,
갈 치(Trichiurus japonicus),
물가자미(Eopsetta grigorjewi)
가출 현하였다.
이들의출현시기와수온을보면,
농어의경우2010
년2
월에수온14.9℃
에서,
감성돔과벵에돔,
돌돔은2009
년6
월에수온18.4℃
에서출현하였으며,
갈치는고수온기인2009
년8
월과10
월에수온28.2-20.7℃
에서,
물가자미는저수온기 인2010
년2
월에14.9℃
에서출현하였다.
고 찰
분자동정에있어서유전자의
PCR
증폭성공률은어란의종동 정가능성을높이는것과직접적으로연관되어있다.
이연구에 서종동정을위해사용한COI
유전자의증폭성공률은94.7%
로
cytochrome b (cyt b)
유전자를이용한PCR
증폭성공률인68.3% (Han et al., 2015)
보다높게나타났다.
이는cyt b
유전자 의증폭을위해서유전자주변tRNA
지역(glutamic acid tRNA
의5'
말단과threonine
또는proline tRNA
의3'
말단)
의염기서열에기초하여디자인한프라이머위치에일부어종에서
tRNA
의 유전자재배열
(Inoue et al., 2001)
이나tRNA
Thr 염기서열 의높은다형성때문인것으로생각된다.
또한Ivanova et al.
(2007)
은COI
유전자의PCR
증폭성공률이96.8%
였다고보고 한바있다.
그러나기존연구에서증폭해서사용한COI
유전자 염기서열의길이는Ivanova et al. (2007)
에의한650 bp, Lee and Kim (2014a)
의510 bp, Lee and Kim (2016)
의515 bp
로 비교적짧은길이를사용하였다.
이번연구는PCR-RFLP band
양상으로prescreening
이가능하도록하기위하여기존의연구 에서증폭해서사용한길이의2-3
배이상의크기인약1,550 bp
의증폭산물을얻고자COI
전체유전자를포함하도록프라이 머를제작하였다.
부유성어란의출현량은해당해역에서의 어류의생산력과 관련이있다고생각된다
.
따라서연구기간동안사계연안에서 채집한어란의출현개체수를다른연구결과와비교하기위하 여전체출현개체수를조사횟수와정점수로 나누어평균출 현개체수로나타내었다(Table 2).
채집시기와기간이서로다 르고출현어종에따라산란량에차이가있어다른지역의연구 결과와직접적인비교는어려우나,
사계연안에서의평균출현 개체수가932
개체로,
기존보고된영일만574
개체(Han et al., 2003),
새만금610
개체(Cha et al., 2004),
울진299
개체(Han and Kim, 2007),
제주도연안해역의506
개체(Han et al., 2015)
보다많아서비교대상인다른지역보다상대적으로높은어 란밀도를나타내었다.
이러한결과는사계연안어류군집에관 한연구(Kim et al., 2014)
의결과에서볼수있듯이삼중자망 에어획된단위면적당생체량(kg/1,000 m
2)
으로환산한CPUE (Catch Per Unit Effort)
값이제주용수리,
포항,
거성,
거제에비 해서사계에서높게나타난점을고려할때사계지역에서의높Saemangeum Jan-Aug, 2003 (5, 9-12) 610.2 4 (8) Cha et al., 2004
Uljin Jan-Oct, 2002 (4, 5) 298.7 5 (7) Han and Kim, 2007
Jejudo Island Aug, 2006-Jul, 2007 (12, 4) 506.0 34 (43) Han et al., 2015
Sagyeoi Apr, 2009-Feb, 2010 (6, 1) 931.7 35 (43) Present study
은어류서식밀도와관련이있을것으로추정되지만어류의서 식밀도와부유성어란의출현량과의관계는앞으로보다세밀한 조사가이루어져야하겠다
.
어류군집의특성을밝히는데중요하게사용되는생태지수중 우점도지수의경우에는단위면적당출현개체수가적고특정어 류의개체수많았던
2009
년12
월과4
월에각각0.81
과0.74
로 높은값을나타내었으며,
출현종수가가장많았던6
월에0.37
로 가장낮게나타났다.
종다양성지수의경우에는 우점도지수와 상반된형태로변화하였고,
출현종수가가장많았던2009
년6
월(H′=2.31)
이가장높았으며,
무점황놀래기한종에의한출현 개체수(53.9%)
가많았던2009
년12
월(H′=1.18)
이가장낮았 다.
균등도지수의경우에는우점도지수가0.53
으로두번째로 낮게나타난2010
년2
월에가장높았으며,
우점도지수가0.86
으로두번째로높았던2009
년4
월에가장낮았다(Fig. 4).
제주도연근해의어란출현종과관련하여
Han et al. (2015)
은 제주도연안에서34
종(43
분류군)
의출현종을보고하였으며,
어 종별로이번연구의어종과합하였을때8
목27
과51
종이나 타났다.
또한Lee et al. (2006)
의보고에따르면제주도서부지 역의자치어를채집한결과총59
종이출현하였으며, Go et al.
(1991)
은제주도북부연안에서도총64
종의자치어가출현한 다고보고한바있다.
따라서,
제주도주변해역은어류의산란 장뿐만아니라자치어의성육장으로도중요한역할을하고있 다고생각되며,
이해역에서의초기생활사에관련된어류자원 의동태파악및관리를위해서앞으로보다다양한장소와시기 를대상으로지속적인관련자료축적이필요하다고생각된다.
사 사
이논문은국립수산과학원수산연구사업
‘
제주주변연근해어 업및환경생태조사(R2017033)’
의지원으로수행된연구입니 다.
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